Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PDE3BQ13370 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PDE3BQ13370 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PDE3BQ13370 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
PDE3BQ13370 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
PDE3BQ13370 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
PDE3BQ13370 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
PDE3BQ13370 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
PDE3BQ13370 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PDE3BQ13370 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PDE3BQ13370 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PDE3BQ13370 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PDE3BQ13370 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
PDE3BQ13370 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PDE3BQ13370 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PDE3BQ13370 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PDE3BQ13370 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PDE3BQ13370 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PDE3BQ13370 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
PDE3BQ13370 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
PDE3BQ13370 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PDE3BQ13370 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PDE3BQ13370 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PDE3BQ13370 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PDE3BQ13370 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PDE3BQ13370 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PDE3BQ13370 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PDE3BQ13370 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PDE3BQ13370 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PDE3BQ13370 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PDE3BQ13370 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PDE3BQ13370 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PDE3BQ13370 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PDE3BQ13370 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PDE3BQ13370 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PDE3BQ13370 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PDE3BQ13370 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PDE3BQ13370 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PDE3BQ13370 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PDE3BQ13370 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PDE3BQ13370 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PDE3BQ13370 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PDE3BQ13370 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PDE3BQ13370 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PDE3BQ13370 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PDE3BQ13370 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PDE3BQ13370 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PDE3BQ13370 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PDE3BQ13370 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
PDE3BQ13370 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PDE3BQ13370 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PDE3BQ13370 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PDE3BQ13370 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PDE3BQ13370 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PDE3BQ13370 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PDE3BQ13370 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PDE3BQ13370 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PDE3BQ13370 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PDE3BQ13370 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PDE3BQ13370 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PDE3BQ13370 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PDE3BQ13370 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PDE3BQ13370 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PDE3BQ13370 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PDE3BQ13370 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PDE3BQ13370 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PDE3BQ13370 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PDE3BQ13370 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PDE3BQ13370 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PDE3BQ13370 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PDE3BQ13370 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PDE3BQ13370 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PDE3BQ13370 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PDE3BQ13370 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PDE3BQ13370 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PDE3BQ13370 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PDE3BQ13370 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PDE3BQ13370 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PDE3BQ13370 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PDE3BQ13370 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PDE3BQ13370 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PDE3BQ13370 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
PDE3BQ13370 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PDE3BQ13370 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PDE3BQ13370 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PDE3BQ13370 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PDE3BQ13370 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PDE3BQ13370 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PDE3BQ13370 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PDE3BQ13370 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
PDE3BQ13370 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
PDE3BQ13370 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PDE3BQ13370 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PDE3BQ13370 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PDE3BQ13370 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PDE3BQ13370 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PDE3BQ13370 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PDE3BQ13370 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PDE3BQ13370 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PDE3BQ13370 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
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