Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SCGB2A2Q13296 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SCGB2A2Q13296 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCGB2A2Q13296 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCGB2A2Q13296 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCGB2A2Q13296 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCGB2A2Q13296 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCGB2A2Q13296 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCGB2A2Q13296 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SCGB2A2Q13296 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCGB2A2Q13296 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCGB2A2Q13296 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCGB2A2Q13296 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCGB2A2Q13296 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCGB2A2Q13296 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCGB2A2Q13296 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCGB2A2Q13296 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCGB2A2Q13296 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCGB2A2Q13296 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SCGB2A2Q13296 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SCGB2A2Q13296 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SCGB2A2Q13296 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SCGB2A2Q13296 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SCGB2A2Q13296 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SCGB2A2Q13296 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SCGB2A2Q13296 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SCGB2A2Q13296 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SCGB2A2Q13296 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SCGB2A2Q13296 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCGB2A2Q13296 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCGB2A2Q13296 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCGB2A2Q13296 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCGB2A2Q13296 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCGB2A2Q13296 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCGB2A2Q13296 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCGB2A2Q13296 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCGB2A2Q13296 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCGB2A2Q13296 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCGB2A2Q13296 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCGB2A2Q13296 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCGB2A2Q13296 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCGB2A2Q13296 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCGB2A2Q13296 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCGB2A2Q13296 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCGB2A2Q13296 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCGB2A2Q13296 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCGB2A2Q13296 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCGB2A2Q13296 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCGB2A2Q13296 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCGB2A2Q13296 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCGB2A2Q13296 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCGB2A2Q13296 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCGB2A2Q13296 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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SCGB2A2Q13296 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCGB2A2Q13296 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCGB2A2Q13296 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCGB2A2Q13296 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCGB2A2Q13296 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCGB2A2Q13296 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCGB2A2Q13296 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCGB2A2Q13296 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCGB2A2Q13296 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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SCGB2A2Q13296 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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SCGB2A2Q13296 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SCGB2A2Q13296 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCGB2A2Q13296 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCGB2A2Q13296 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCGB2A2Q13296 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCGB2A2Q13296 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCGB2A2Q13296 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCGB2A2Q13296 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCGB2A2Q13296 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCGB2A2Q13296 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCGB2A2Q13296 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCGB2A2Q13296 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCGB2A2Q13296 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCGB2A2Q13296 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCGB2A2Q13296 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCGB2A2Q13296 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCGB2A2Q13296 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCGB2A2Q13296 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCGB2A2Q13296 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCGB2A2Q13296 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCGB2A2Q13296 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCGB2A2Q13296 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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