Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
GRIN2BQ13224 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
GRIN2BQ13224 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
GRIN2BQ13224 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.5■■■■■ 4.71
GRIN2BQ13224 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
GRIN2BQ13224 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
GRIN2BQ13224 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
GRIN2BQ13224 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
GRIN2BQ13224 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
GRIN2BQ13224 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
GRIN2BQ13224 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC44.49■■■■■ 4.71
GRIN2BQ13224 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
GRIN2BQ13224 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.46■■■■■ 4.71
GRIN2BQ13224 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
GRIN2BQ13224 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC44.46■■■■■ 4.71
GRIN2BQ13224 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
GRIN2BQ13224 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
GRIN2BQ13224 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.39■■■■■ 4.7
GRIN2BQ13224 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
GRIN2BQ13224 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
GRIN2BQ13224 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
GRIN2BQ13224 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
GRIN2BQ13224 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC44.35■■■■■ 4.69
GRIN2BQ13224 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
GRIN2BQ13224 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC44.35■■■■■ 4.69
GRIN2BQ13224 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.34■■■■■ 4.69
GRIN2BQ13224 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
GRIN2BQ13224 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
GRIN2BQ13224 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC44.34■■■■■ 4.69
GRIN2BQ13224 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC44.33■■■■■ 4.69
GRIN2BQ13224 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
GRIN2BQ13224 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
GRIN2BQ13224 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC44.3■■■■■ 4.68
GRIN2BQ13224 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
GRIN2BQ13224 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
GRIN2BQ13224 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
GRIN2BQ13224 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC44.29■■■■■ 4.68
GRIN2BQ13224 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
GRIN2BQ13224 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.28■■■■■ 4.68
GRIN2BQ13224 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC44.28■■■■■ 4.68
GRIN2BQ13224 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
GRIN2BQ13224 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
GRIN2BQ13224 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.25■■■■■ 4.67
GRIN2BQ13224 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC44.24■■■■■ 4.67
GRIN2BQ13224 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
GRIN2BQ13224 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
GRIN2BQ13224 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
GRIN2BQ13224 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
GRIN2BQ13224 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
GRIN2BQ13224 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
GRIN2BQ13224 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC44.19■■■■■ 4.66
GRIN2BQ13224 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC44.18■■■■■ 4.66
GRIN2BQ13224 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
GRIN2BQ13224 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC44.14■■■■■ 4.66
GRIN2BQ13224 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC44.13■■■■■ 4.66
GRIN2BQ13224 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC44.12■■■■■ 4.65
GRIN2BQ13224 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC44.11■■■■■ 4.65
GRIN2BQ13224 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.1■■■■■ 4.65
GRIN2BQ13224 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC44.08■■■■■ 4.65
GRIN2BQ13224 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
GRIN2BQ13224 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
GRIN2BQ13224 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC44.07■■■■■ 4.65
GRIN2BQ13224 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
GRIN2BQ13224 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC44.07■■■■■ 4.65
GRIN2BQ13224 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC44.04■■■■■ 4.64
GRIN2BQ13224 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC44.04■■■■■ 4.64
GRIN2BQ13224 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
GRIN2BQ13224 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC44.03■■■■■ 4.64
GRIN2BQ13224 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC44.02■■■■■ 4.64
GRIN2BQ13224 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC44.02■■■■■ 4.64
GRIN2BQ13224 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC44.01■■■■■ 4.64
GRIN2BQ13224 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC44.01■■■■■ 4.64
GRIN2BQ13224 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC44■■■■■ 4.63
GRIN2BQ13224 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
GRIN2BQ13224 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
GRIN2BQ13224 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
GRIN2BQ13224 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
GRIN2BQ13224 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC43.94■■■■■ 4.62
GRIN2BQ13224 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC43.93■■■■■ 4.62
GRIN2BQ13224 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC43.92■■■■■ 4.62
GRIN2BQ13224 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC43.92■■■■■ 4.62
GRIN2BQ13224 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
GRIN2BQ13224 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
GRIN2BQ13224 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
GRIN2BQ13224 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
GRIN2BQ13224 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
GRIN2BQ13224 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
GRIN2BQ13224 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
GRIN2BQ13224 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC43.88■■■■■ 4.61
GRIN2BQ13224 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC43.87■■■■■ 4.61
GRIN2BQ13224 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC43.87■■■■■ 4.61
GRIN2BQ13224 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC43.86■■■■■ 4.61
GRIN2BQ13224 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
GRIN2BQ13224 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.85■■■■■ 4.61
GRIN2BQ13224 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.84■■■■■ 4.61
GRIN2BQ13224 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.83■■■■■ 4.61
GRIN2BQ13224 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
GRIN2BQ13224 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.6
GRIN2BQ13224 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.82■■■■■ 4.6
GRIN2BQ13224 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC43.79■■■■■ 4.6
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