Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKAA1Q13131 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKAA1Q13131 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKAA1Q13131 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKAA1Q13131 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKAA1Q13131 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKAA1Q13131 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKAA1Q13131 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
PRKAA1Q13131 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKAA1Q13131 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKAA1Q13131 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKAA1Q13131 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKAA1Q13131 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKAA1Q13131 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKAA1Q13131 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKAA1Q13131 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKAA1Q13131 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKAA1Q13131 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKAA1Q13131 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKAA1Q13131 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKAA1Q13131 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKAA1Q13131 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKAA1Q13131 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKAA1Q13131 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKAA1Q13131 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKAA1Q13131 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKAA1Q13131 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKAA1Q13131 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKAA1Q13131 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKAA1Q13131 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRKAA1Q13131 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRKAA1Q13131 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRKAA1Q13131 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRKAA1Q13131 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKAA1Q13131 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKAA1Q13131 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKAA1Q13131 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKAA1Q13131 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKAA1Q13131 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKAA1Q13131 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKAA1Q13131 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKAA1Q13131 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKAA1Q13131 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKAA1Q13131 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKAA1Q13131 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRKAA1Q13131 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRKAA1Q13131 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRKAA1Q13131 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKAA1Q13131 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKAA1Q13131 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKAA1Q13131 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKAA1Q13131 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKAA1Q13131 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKAA1Q13131 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKAA1Q13131 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKAA1Q13131 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKAA1Q13131 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKAA1Q13131 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKAA1Q13131 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKAA1Q13131 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKAA1Q13131 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKAA1Q13131 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKAA1Q13131 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKAA1Q13131 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKAA1Q13131 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKAA1Q13131 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKAA1Q13131 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKAA1Q13131 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRKAA1Q13131 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKAA1Q13131 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKAA1Q13131 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKAA1Q13131 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKAA1Q13131 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKAA1Q13131 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKAA1Q13131 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKAA1Q13131 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKAA1Q13131 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKAA1Q13131 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKAA1Q13131 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKAA1Q13131 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKAA1Q13131 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKAA1Q13131 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKAA1Q13131 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKAA1Q13131 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKAA1Q13131 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKAA1Q13131 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKAA1Q13131 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKAA1Q13131 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKAA1Q13131 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKAA1Q13131 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKAA1Q13131 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKAA1Q13131 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKAA1Q13131 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKAA1Q13131 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKAA1Q13131 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKAA1Q13131 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKAA1Q13131 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKAA1Q13131 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKAA1Q13131 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKAA1Q13131 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
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