Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TRAF1Q13077 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TRAF1Q13077 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TRAF1Q13077 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
TRAF1Q13077 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TRAF1Q13077 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRAF1Q13077 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRAF1Q13077 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
TRAF1Q13077 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRAF1Q13077 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRAF1Q13077 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRAF1Q13077 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
TRAF1Q13077 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRAF1Q13077 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRAF1Q13077 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRAF1Q13077 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRAF1Q13077 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRAF1Q13077 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRAF1Q13077 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRAF1Q13077 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRAF1Q13077 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRAF1Q13077 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRAF1Q13077 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRAF1Q13077 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TRAF1Q13077 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TRAF1Q13077 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
TRAF1Q13077 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRAF1Q13077 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRAF1Q13077 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
TRAF1Q13077 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRAF1Q13077 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRAF1Q13077 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRAF1Q13077 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRAF1Q13077 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRAF1Q13077 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TRAF1Q13077 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TRAF1Q13077 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TRAF1Q13077 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRAF1Q13077 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRAF1Q13077 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRAF1Q13077 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRAF1Q13077 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRAF1Q13077 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRAF1Q13077 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRAF1Q13077 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRAF1Q13077 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRAF1Q13077 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRAF1Q13077 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRAF1Q13077 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRAF1Q13077 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRAF1Q13077 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRAF1Q13077 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRAF1Q13077 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRAF1Q13077 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRAF1Q13077 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRAF1Q13077 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRAF1Q13077 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRAF1Q13077 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRAF1Q13077 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
TRAF1Q13077 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRAF1Q13077 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRAF1Q13077 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRAF1Q13077 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRAF1Q13077 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAF1Q13077 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAF1Q13077 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAF1Q13077 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAF1Q13077 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRAF1Q13077 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRAF1Q13077 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRAF1Q13077 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TRAF1Q13077 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TRAF1Q13077 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
TRAF1Q13077 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRAF1Q13077 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRAF1Q13077 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRAF1Q13077 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRAF1Q13077 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRAF1Q13077 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRAF1Q13077 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRAF1Q13077 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRAF1Q13077 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TRAF1Q13077 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRAF1Q13077 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TRAF1Q13077 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TRAF1Q13077 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TRAF1Q13077 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TRAF1Q13077 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TRAF1Q13077 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAF1Q13077 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAF1Q13077 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAF1Q13077 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAF1Q13077 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRAF1Q13077 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRAF1Q13077 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
TRAF1Q13077 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
TRAF1Q13077 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
TRAF1Q13077 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRAF1Q13077 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRAF1Q13077 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
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