Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
PRDM2Q13029 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.28■■■■■ 5
PRDM2Q13029 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
PRDM2Q13029 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
PRDM2Q13029 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
PRDM2Q13029 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.26■■■■■ 5
PRDM2Q13029 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC46.23■■■■■ 4.99
PRDM2Q13029 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC46.23■■■■■ 4.99
PRDM2Q13029 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
PRDM2Q13029 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC46.22■■■■■ 4.99
PRDM2Q13029 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
PRDM2Q13029 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC46.2■■■■■ 4.99
PRDM2Q13029 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.98
PRDM2Q13029 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
PRDM2Q13029 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
PRDM2Q13029 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
PRDM2Q13029 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC46.17■■■■■ 4.98
PRDM2Q13029 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.17■■■■■ 4.98
PRDM2Q13029 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC46.15■■■■■ 4.98
PRDM2Q13029 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
PRDM2Q13029 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
PRDM2Q13029 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC46.1■■■■■ 4.97
PRDM2Q13029 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC46.1■■■■■ 4.97
PRDM2Q13029 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.1■■■■■ 4.97
PRDM2Q13029 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC46.09■■■■■ 4.97
PRDM2Q13029 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
PRDM2Q13029 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
PRDM2Q13029 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
PRDM2Q13029 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC46.06■■■■■ 4.96
PRDM2Q13029 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
PRDM2Q13029 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
PRDM2Q13029 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
PRDM2Q13029 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
PRDM2Q13029 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
PRDM2Q13029 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
PRDM2Q13029 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
PRDM2Q13029 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
PRDM2Q13029 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC46.04■■■■■ 4.96
PRDM2Q13029 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
PRDM2Q13029 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
PRDM2Q13029 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.95
PRDM2Q13029 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
PRDM2Q13029 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.95
PRDM2Q13029 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.93■■■■■ 4.94
PRDM2Q13029 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC45.92■■■■■ 4.94
PRDM2Q13029 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.92■■■■■ 4.94
PRDM2Q13029 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC45.92■■■■■ 4.94
PRDM2Q13029 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC45.92■■■■■ 4.94
PRDM2Q13029 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC45.92■■■■■ 4.94
PRDM2Q13029 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
PRDM2Q13029 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC45.92■■■■■ 4.94
PRDM2Q13029 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC45.91■■■■■ 4.94
PRDM2Q13029 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC45.9■■■■■ 4.94
PRDM2Q13029 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC45.89■■■■■ 4.94
PRDM2Q13029 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.88■■■■■ 4.93
PRDM2Q13029 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.86■■■■■ 4.93
PRDM2Q13029 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC45.85■■■■■ 4.93
PRDM2Q13029 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
PRDM2Q13029 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
PRDM2Q13029 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
PRDM2Q13029 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
PRDM2Q13029 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC45.83■■■■■ 4.93
PRDM2Q13029 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC45.83■■■■■ 4.93
PRDM2Q13029 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
PRDM2Q13029 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.82■■■■■ 4.93
PRDM2Q13029 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC45.79■■■■■ 4.92
PRDM2Q13029 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
PRDM2Q13029 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
PRDM2Q13029 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
PRDM2Q13029 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC45.77■■■■■ 4.92
PRDM2Q13029 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
PRDM2Q13029 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
PRDM2Q13029 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
PRDM2Q13029 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.74■■■■■ 4.91
PRDM2Q13029 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC45.72■■■■■ 4.91
PRDM2Q13029 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
PRDM2Q13029 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC45.72■■■■■ 4.91
PRDM2Q13029 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
PRDM2Q13029 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.69■■■■■ 4.9
PRDM2Q13029 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC45.69■■■■■ 4.9
PRDM2Q13029 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
PRDM2Q13029 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC45.68■■■■■ 4.9
PRDM2Q13029 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC45.68■■■■■ 4.9
PRDM2Q13029 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC45.68■■■■■ 4.9
PRDM2Q13029 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.67■■■■■ 4.9
PRDM2Q13029 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
PRDM2Q13029 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC45.66■■■■■ 4.9
PRDM2Q13029 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
PRDM2Q13029 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
PRDM2Q13029 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.65■■■■■ 4.9
PRDM2Q13029 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
PRDM2Q13029 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
PRDM2Q13029 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC45.61■■■■■ 4.89
PRDM2Q13029 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
PRDM2Q13029 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC45.6■■■■■ 4.89
PRDM2Q13029 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
PRDM2Q13029 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC45.59■■■■■ 4.89
PRDM2Q13029 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.59■■■■■ 4.89
PRDM2Q13029 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
PRDM2Q13029 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC45.59■■■■■ 4.89
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