Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 NAS2YIL007C 663 nt8.95□□□□□ -0.98
LCB4Q12246 RRT8YOL048C 1029 nt8.95□□□□□ -0.98
LCB4Q12246 IGD1YFR017C 588 nt8.94□□□□□ -0.98
LCB4Q12246 ABZ2YMR289W 1125 nt8.94□□□□□ -0.98
LCB4Q12246 RIM8YGL045W 1629 nt8.94□□□□□ -0.98
LCB4Q12246 CCT2YIL142W 1584 nt8.93□□□□□ -0.98
LCB4Q12246 OPI3YJR073C 621 nt8.92□□□□□ -0.98
LCB4Q12246 YJR114WYJR114W 393 nt8.92□□□□□ -0.98
LCB4Q12246 SPE2YOL052C 1191 nt8.92□□□□□ -0.98
LCB4Q12246 TVP23YDR084C 600 nt8.91□□□□□ -0.98
LCB4Q12246 CDD1YLR245C 429 nt8.91□□□□□ -0.98
LCB4Q12246 MUP1YGR055W 1725 nt8.91□□□□□ -0.98
LCB4Q12246 TIM44YIL022W 1296 nt8.89□□□□□ -0.99
LCB4Q12246 BET2YPR176C 978 nt8.89□□□□□ -0.99
LCB4Q12246 SAC7YDR389W 1965 nt8.89□□□□□ -0.99
LCB4Q12246 ENO2YHR174W 1314 nt8.87□□□□□ -0.99
LCB4Q12246 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt8.87□□□□□ -0.99
LCB4Q12246 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt8.87□□□□□ -0.99
LCB4Q12246 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt8.87□□□□□ -0.99
LCB4Q12246 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt8.87□□□□□ -0.99
LCB4Q12246 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt8.87□□□□□ -0.99
LCB4Q12246 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt8.87□□□□□ -0.99
LCB4Q12246 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt8.87□□□□□ -0.99
LCB4Q12246 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt8.87□□□□□ -0.99
LCB4Q12246 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt8.87□□□□□ -0.99
LCB4Q12246 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt8.87□□□□□ -0.99
LCB4Q12246 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt8.87□□□□□ -0.99
LCB4Q12246 YGL114WYGL114W 2178 nt8.87□□□□□ -0.99
LCB4Q12246 TPC1YGR096W 945 nt8.86□□□□□ -0.99
LCB4Q12246 ILV3YJR016C 1758 nt8.86□□□□□ -0.99
LCB4Q12246 OPI10YOL032W 741 nt8.85□□□□□ -0.99
LCB4Q12246 HOL1YNR055C 1761 nt8.84□□□□□ -0.99
LCB4Q12246 IPL1YPL209C 1104 nt8.84□□□□□ -0.99
LCB4Q12246 LSB6YJL100W 1824 nt8.84□□□□□ -0.99
LCB4Q12246 YCR025CYCR025C 411 nt8.82□□□□□ -1
LCB4Q12246 YLR046CYLR046C 813 nt8.82□□□□□ -1
LCB4Q12246 ELO1YJL196C 933 nt8.81□□□□□ -1
LCB4Q12246 ACO2YJL200C 2370 nt8.81□□□□□ -1
LCB4Q12246 THP3YPR045C 1413 nt8.8□□□□□ -1
LCB4Q12246 QDR2YIL121W 1629 nt8.8□□□□□ -1
LCB4Q12246 ADH3YMR083W 1128 nt8.8□□□□□ -1
LCB4Q12246 YNR064CYNR064C 873 nt8.8□□□□□ -1
LCB4Q12246 AMF1YOR378W 1548 nt8.8□□□□□ -1
LCB4Q12246 SAM50YNL026W 1455 nt8.79□□□□□ -1
LCB4Q12246 DIG1YPL049C 1359 nt8.79□□□□□ -1
LCB4Q12246 ENT4YLL038C 744 nt8.79□□□□□ -1
LCB4Q12246 PHB2YGR231C 933 nt8.78□□□□□ -1
LCB4Q12246 FLX1YIL134W 936 nt8.78□□□□□ -1
LCB4Q12246 LYS20YDL182W 1287 nt8.77□□□□□ -1.01
LCB4Q12246 ITR2YOL103W 1830 nt8.77□□□□□ -1.01
LCB4Q12246 ARO8YGL202W 1503 nt8.76□□□□□ -1.01
LCB4Q12246 MOB1YIL106W 945 nt8.76□□□□□ -1.01
LCB4Q12246 PCP1YGR101W 1041 nt8.75□□□□□ -1.01
LCB4Q12246 YKR012CYKR012C 378 nt8.75□□□□□ -1.01
LCB4Q12246 ERG6YML008C 1152 nt8.75□□□□□ -1.01
LCB4Q12246 MAE1YKL029C 2010 nt8.75□□□□□ -1.01
LCB4Q12246 SOD2YHR008C 702 nt8.74□□□□□ -1.01
LCB4Q12246 YCP4YCR004C 744 nt8.73□□□□□ -1.01
LCB4Q12246 RIB1YBL033C 1038 nt8.73□□□□□ -1.01
LCB4Q12246 NAM8YHR086W 1572 nt8.73□□□□□ -1.01
LCB4Q12246 GID8YMR135C 1368 nt8.73□□□□□ -1.01
LCB4Q12246 LEU2YCL018W 1095 nt8.72□□□□□ -1.01
LCB4Q12246 SFL1YOR140W 2301 nt8.71□□□□□ -1.01
LCB4Q12246 DLD3YEL071W 1491 nt8.71□□□□□ -1.01
LCB4Q12246 YIA6YIL006W 1122 nt8.71□□□□□ -1.02
LCB4Q12246 FSH2YMR222C 672 nt8.69□□□□□ -1.02
LCB4Q12246 LSR1LSR1 1175 nt8.69□□□□□ -1.02
LCB4Q12246 KEL3YPL263C 1956 nt8.69□□□□□ -1.02
LCB4Q12246 KES1YPL145C 1305 nt8.69□□□□□ -1.02
LCB4Q12246 YKL053WYKL053W 375 nt8.68□□□□□ -1.02
LCB4Q12246 SWT21YNL187W 1074 nt8.68□□□□□ -1.02
LCB4Q12246 COQ8YGL119W 1506 nt8.68□□□□□ -1.02
LCB4Q12246 MET1YKR069W 1782 nt8.68□□□□□ -1.02
LCB4Q12246 MRS6YOR370C 1812 nt8.68□□□□□ -1.02
LCB4Q12246 YHR219WYHR219W 1875 nt8.67□□□□□ -1.02
LCB4Q12246 SUV3YPL029W 2214 nt8.66□□□□□ -1.02
LCB4Q12246 YKL133CYKL133C 1392 nt8.65□□□□□ -1.02
LCB4Q12246 TGA1tA(UGC)A 73 nt8.65□□□□□ -1.02
LCB4Q12246 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt8.65□□□□□ -1.02
LCB4Q12246 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt8.65□□□□□ -1.02
LCB4Q12246 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt8.65□□□□□ -1.02
LCB4Q12246 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt8.65□□□□□ -1.02
LCB4Q12246 SWM1YDR260C 513 nt8.65□□□□□ -1.02
LCB4Q12246 SER2YGR208W 930 nt8.65□□□□□ -1.02
LCB4Q12246 SDS24YBR214W 1584 nt8.65□□□□□ -1.03
LCB4Q12246 CYC3YAL039C 810 nt8.64□□□□□ -1.03
LCB4Q12246 MET2YNL277W 1461 nt8.64□□□□□ -1.03
LCB4Q12246 CRC1YOR100C 984 nt8.63□□□□□ -1.03
LCB4Q12246 SGA1YIL099W 1650 nt8.62□□□□□ -1.03
LCB4Q12246 REX2YLR059C 810 nt8.61□□□□□ -1.03
LCB4Q12246 HAP5YOR358W 729 nt8.61□□□□□ -1.03
LCB4Q12246 FCY1YPR062W 477 nt8.61□□□□□ -1.03
LCB4Q12246 VBA3YCL069W 1377 nt8.61□□□□□ -1.03
LCB4Q12246 YMR209CYMR209C 1374 nt8.61□□□□□ -1.03
LCB4Q12246 YMR265CYMR265C 1386 nt8.6□□□□□ -1.03
LCB4Q12246 UGP1YKL035W 1500 nt8.59□□□□□ -1.03
LCB4Q12246 YLR280CYLR280C 351 nt8.59□□□□□ -1.03
LCB4Q12246 VMA11YPL234C 495 nt8.59□□□□□ -1.03
LCB4Q12246 SRP54YPR088C 1626 nt8.58□□□□□ -1.04
LCB4Q12246 ENO1YGR254W 1314 nt8.58□□□□□ -1.04
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