Protein–RNA interactions for Protein: Q12229

UBX3, UBX domain-containing protein 3, yeastyeast

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX3Q12229 SSL2YIL143C 2532 nt8.68□□□□□ -1.02
UBX3Q12229 ADE8YDR408C 645 nt8.68□□□□□ -1.02
UBX3Q12229 LSR1LSR1 1175 nt8.67□□□□□ -1.02
UBX3Q12229 YJR114WYJR114W 393 nt8.66□□□□□ -1.02
UBX3Q12229 IML3YBR107C 738 nt8.66□□□□□ -1.02
UBX3Q12229 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt8.65□□□□□ -1.02
UBX3Q12229 OPI3YJR073C 621 nt8.65□□□□□ -1.02
UBX3Q12229 SPS100YHR139C 981 nt8.64□□□□□ -1.03
UBX3Q12229 MHF1YOL086W-A 273 nt8.64□□□□□ -1.03
UBX3Q12229 ODC1YPL134C 933 nt8.64□□□□□ -1.03
UBX3Q12229 TVP23YDR084C 600 nt8.63□□□□□ -1.03
UBX3Q12229 YMR209CYMR209C 1374 nt8.62□□□□□ -1.03
UBX3Q12229 CWP2YKL096W-A 279 nt8.62□□□□□ -1.03
UBX3Q12229 ESBP6YNL125C 2022 nt8.62□□□□□ -1.03
UBX3Q12229 HEL2YDR266C 1920 nt8.61□□□□□ -1.03
UBX3Q12229 YNR064CYNR064C 873 nt8.61□□□□□ -1.03
UBX3Q12229 CPD1YGR247W 720 nt8.6□□□□□ -1.03
UBX3Q12229 VMA11YPL234C 495 nt8.6□□□□□ -1.03
UBX3Q12229 MCM5YLR274W 2328 nt8.59□□□□□ -1.03
UBX3Q12229 RPD3YNL330C 1302 nt8.59□□□□□ -1.03
UBX3Q12229 ELO1YJL196C 933 nt8.59□□□□□ -1.03
UBX3Q12229 TAF13YML098W 504 nt8.59□□□□□ -1.03
UBX3Q12229 SUV3YPL029W 2214 nt8.57□□□□□ -1.04
UBX3Q12229 SFL1YOR140W 2301 nt8.56□□□□□ -1.04
UBX3Q12229 POT1YIL160C 1254 nt8.56□□□□□ -1.04
UBX3Q12229 YMR262WYMR262W 942 nt8.56□□□□□ -1.04
UBX3Q12229 TIP1YBR067C 633 nt8.56□□□□□ -1.04
UBX3Q12229 MAS1YLR163C 1389 nt8.56□□□□□ -1.04
UBX3Q12229 ADH7YCR105W 1086 nt8.55□□□□□ -1.04
UBX3Q12229 ABZ2YMR289W 1125 nt8.55□□□□□ -1.04
UBX3Q12229 YMR265CYMR265C 1386 nt8.54□□□□□ -1.04
UBX3Q12229 SNX3YOR357C 489 nt8.54□□□□□ -1.04
UBX3Q12229 KEL3YPL263C 1956 nt8.53□□□□□ -1.04
UBX3Q12229 NIF3YGL221C 867 nt8.53□□□□□ -1.04
UBX3Q12229 DMA2YNL116W 1569 nt8.52□□□□□ -1.04
UBX3Q12229 TIM44YIL022W 1296 nt8.51□□□□□ -1.05
UBX3Q12229 PAU15YIR041W 375 nt8.51□□□□□ -1.05
UBX3Q12229 MDM35YKL053C-A 261 nt8.51□□□□□ -1.05
UBX3Q12229 SWT21YNL187W 1074 nt8.51□□□□□ -1.05
UBX3Q12229 HAP5YOR358W 729 nt8.51□□□□□ -1.05
UBX3Q12229 HEM14YER014W 1620 nt8.51□□□□□ -1.05
UBX3Q12229 APS2YJR058C 444 nt8.5□□□□□ -1.05
UBX3Q12229 TUB4YLR212C 1422 nt8.49□□□□□ -1.05
UBX3Q12229 DPL1YDR294C 1770 nt8.49□□□□□ -1.05
UBX3Q12229 RPC31YNL151C 756 nt8.49□□□□□ -1.05
UBX3Q12229 AMF1YOR378W 1548 nt8.49□□□□□ -1.05
UBX3Q12229 PCP1YGR101W 1041 nt8.48□□□□□ -1.05
UBX3Q12229 GSF2YML048W 1212 nt8.48□□□□□ -1.05
UBX3Q12229 MET1YKR069W 1782 nt8.48□□□□□ -1.05
UBX3Q12229 CRC1YOR100C 984 nt8.47□□□□□ -1.05
UBX3Q12229 RIM2YBR192W 1134 nt8.47□□□□□ -1.05
UBX3Q12229 KRR1YCL059C 951 nt8.46□□□□□ -1.06
UBX3Q12229 YHR218WYHR218W 1812 nt8.45□□□□□ -1.06
UBX3Q12229 RPN14YGL004C 1254 nt8.45□□□□□ -1.06
UBX3Q12229 PGC1YPL206C 966 nt8.45□□□□□ -1.06
UBX3Q12229 MAE1YKL029C 2010 nt8.44□□□□□ -1.06
UBX3Q12229 DTR1YBR180W 1719 nt8.44□□□□□ -1.06
UBX3Q12229 PAU5YFL020C 369 nt8.44□□□□□ -1.06
UBX3Q12229 ENO2YHR174W 1314 nt8.44□□□□□ -1.06
UBX3Q12229 PSD1YNL169C 1503 nt8.44□□□□□ -1.06
UBX3Q12229 CDD1YLR245C 429 nt8.43□□□□□ -1.06
UBX3Q12229 snR31snR31 225 nt8.43□□□□□ -1.06
UBX3Q12229 TPC1YGR096W 945 nt8.42□□□□□ -1.06
UBX3Q12229 NAS2YIL007C 663 nt8.42□□□□□ -1.06
UBX3Q12229 YKL053WYKL053W 375 nt8.42□□□□□ -1.06
UBX3Q12229 HXT10YFL011W 1641 nt8.42□□□□□ -1.06
UBX3Q12229 ESS1YJR017C 513 nt8.41□□□□□ -1.06
UBX3Q12229 RFC1YOR217W 2586 nt8.41□□□□□ -1.06
UBX3Q12229 ILV2YMR108W 2064 nt8.4□□□□□ -1.06
UBX3Q12229 STP3YLR375W 1032 nt8.39□□□□□ -1.07
UBX3Q12229 KGD2YDR148C 1392 nt8.38□□□□□ -1.07
UBX3Q12229 YBR232CYBR232C 360 nt8.38□□□□□ -1.07
UBX3Q12229 LEU2YCL018W 1095 nt8.38□□□□□ -1.07
UBX3Q12229 LEU4YNL104C 1860 nt8.38□□□□□ -1.07
UBX3Q12229 ACO2YJL200C 2370 nt8.37□□□□□ -1.07
UBX3Q12229 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt8.37□□□□□ -1.07
UBX3Q12229 CYT1YOR065W 930 nt8.37□□□□□ -1.07
UBX3Q12229 SAN1YDR143C 1833 nt8.37□□□□□ -1.07
UBX3Q12229 THP3YPR045C 1413 nt8.37□□□□□ -1.07
UBX3Q12229 NAM8YHR086W 1572 nt8.36□□□□□ -1.07
UBX3Q12229 RSC4YKR008W 1878 nt8.36□□□□□ -1.07
UBX3Q12229 AGP3YFL055W 1677 nt8.35□□□□□ -1.07
UBX3Q12229 SPE2YOL052C 1191 nt8.35□□□□□ -1.07
UBX3Q12229 MET2YNL277W 1461 nt8.34□□□□□ -1.07
UBX3Q12229 PAR32YDL173W 888 nt8.33□□□□□ -1.08
UBX3Q12229 FSH2YMR222C 672 nt8.32□□□□□ -1.08
UBX3Q12229 KRE1YNL322C 942 nt8.32□□□□□ -1.08
UBX3Q12229 IGD1YFR017C 588 nt8.31□□□□□ -1.08
UBX3Q12229 SRP54YPR088C 1626 nt8.31□□□□□ -1.08
UBX3Q12229 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt8.3□□□□□ -1.08
UBX3Q12229 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt8.3□□□□□ -1.08
UBX3Q12229 REX2YLR059C 810 nt8.3□□□□□ -1.08
UBX3Q12229 THI3YDL080C 1830 nt8.29□□□□□ -1.08
UBX3Q12229 YDR467CYDR467C 327 nt8.28□□□□□ -1.08
UBX3Q12229 PHB2YGR231C 933 nt8.28□□□□□ -1.08
UBX3Q12229 SBP1YHL034C 885 nt8.28□□□□□ -1.08
UBX3Q12229 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt8.28□□□□□ -1.08
UBX3Q12229 YRF1-2YER190W 5046 nt8.28□□□□□ -1.08
UBX3Q12229 NPP1YCR026C 2229 nt8.27□□□□□ -1.08
UBX3Q12229 INH1YDL181W 258 nt8.27□□□□□ -1.09
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