Protein–RNA interactions for Protein: Q12186

MSL5, Branchpoint-bridging protein, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSL5Q12186 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt8.02□□□□□ -1.13
MSL5Q12186 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt8.02□□□□□ -1.13
MSL5Q12186 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt8.02□□□□□ -1.13
MSL5Q12186 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt8.02□□□□□ -1.13
MSL5Q12186 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt8.02□□□□□ -1.13
MSL5Q12186 ACO2YJL200C 2370 nt8.02□□□□□ -1.13
MSL5Q12186 RIM8YGL045W 1629 nt8.01□□□□□ -1.13
MSL5Q12186 RAS2YNL098C 969 nt8.01□□□□□ -1.13
MSL5Q12186 MAS1YLR163C 1389 nt8□□□□□ -1.13
MSL5Q12186 UFO1YML088W 2007 nt8□□□□□ -1.13
MSL5Q12186 SAM2YDR502C 1155 nt7.99□□□□□ -1.13
MSL5Q12186 EAF3YPR023C 1206 nt7.99□□□□□ -1.13
MSL5Q12186 FUB1YCR076C 753 nt7.97□□□□□ -1.13
MSL5Q12186 YER188WYER188W 720 nt7.97□□□□□ -1.13
MSL5Q12186 CDD1YLR245C 429 nt7.97□□□□□ -1.13
MSL5Q12186 MET8YBR213W 825 nt7.97□□□□□ -1.13
MSL5Q12186 DPS1YLL018C 1674 nt7.96□□□□□ -1.13
MSL5Q12186 LYS20YDL182W 1287 nt7.96□□□□□ -1.14
MSL5Q12186 SHY1YGR112W 1170 nt7.96□□□□□ -1.14
MSL5Q12186 TMA23YMR269W 636 nt7.96□□□□□ -1.14
MSL5Q12186 RPL12BYDR418W 498 nt7.95□□□□□ -1.14
MSL5Q12186 YMR007WYMR007W 381 nt7.95□□□□□ -1.14
MSL5Q12186 YOR343CYOR343C 327 nt7.94□□□□□ -1.14
MSL5Q12186 YGL114WYGL114W 2178 nt7.93□□□□□ -1.14
MSL5Q12186 SPS100YHR139C 981 nt7.93□□□□□ -1.14
MSL5Q12186 OYE3YPL171C 1203 nt7.93□□□□□ -1.14
MSL5Q12186 NAS2YIL007C 663 nt7.92□□□□□ -1.14
MSL5Q12186 URA6YKL024C 615 nt7.92□□□□□ -1.14
MSL5Q12186 RCR1YBR005W 642 nt7.92□□□□□ -1.14
MSL5Q12186 IMO32YGR031W 1029 nt7.91□□□□□ -1.14
MSL5Q12186 FLX1YIL134W 936 nt7.91□□□□□ -1.14
MSL5Q12186 GNP1YDR508C 1992 nt7.91□□□□□ -1.14
MSL5Q12186 DDI1YER143W 1287 nt7.89□□□□□ -1.15
MSL5Q12186 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt7.89□□□□□ -1.15
MSL5Q12186 YLR173WYLR173W 1827 nt7.89□□□□□ -1.15
MSL5Q12186 PET8YNL003C 855 nt7.88□□□□□ -1.15
MSL5Q12186 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt7.87□□□□□ -1.15
MSL5Q12186 NSG2YNL156C 900 nt7.87□□□□□ -1.15
MSL5Q12186 DLD2YDL178W 1593 nt7.87□□□□□ -1.15
MSL5Q12186 YOR268CYOR268C 399 nt7.86□□□□□ -1.15
MSL5Q12186 THP3YPR045C 1413 nt7.86□□□□□ -1.15
MSL5Q12186 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt7.85□□□□□ -1.15
MSL5Q12186 SER2YGR208W 930 nt7.85□□□□□ -1.15
MSL5Q12186 BIO5YNR056C 1686 nt7.85□□□□□ -1.15
MSL5Q12186 OSH7YHR001W 1314 nt7.84□□□□□ -1.15
MSL5Q12186 TOM71YHR117W 1920 nt7.84□□□□□ -1.15
MSL5Q12186 LSM5YER146W 282 nt7.84□□□□□ -1.15
MSL5Q12186 HRA1HRA1 564 nt7.84□□□□□ -1.15
MSL5Q12186 FLR1YBR008C 1647 nt7.83□□□□□ -1.16
MSL5Q12186 MFG1YDL233W 1377 nt7.83□□□□□ -1.16
MSL5Q12186 SOL2YCR073W-A 948 nt7.82□□□□□ -1.16
MSL5Q12186 PAM17YKR065C 594 nt7.82□□□□□ -1.16
MSL5Q12186 RSC8YFR037C 1674 nt7.82□□□□□ -1.16
MSL5Q12186 PHB2YGR231C 933 nt7.81□□□□□ -1.16
MSL5Q12186 FSH2YMR222C 672 nt7.81□□□□□ -1.16
MSL5Q12186 ABZ2YMR289W 1125 nt7.81□□□□□ -1.16
MSL5Q12186 REG2YBR050C 1017 nt7.81□□□□□ -1.16
MSL5Q12186 HTS1YPR033C 1641 nt7.81□□□□□ -1.16
MSL5Q12186 CYC3YAL039C 810 nt7.8□□□□□ -1.16
MSL5Q12186 ADH3YMR083W 1128 nt7.8□□□□□ -1.16
MSL5Q12186 RRT8YOL048C 1029 nt7.8□□□□□ -1.16
MSL5Q12186 TPN1YGL186C 1740 nt7.8□□□□□ -1.16
MSL5Q12186 SNF1YDR477W 1902 nt7.8□□□□□ -1.16
MSL5Q12186 SPE2YOL052C 1191 nt7.79□□□□□ -1.16
MSL5Q12186 GRH1YDR517W 1119 nt7.78□□□□□ -1.16
MSL5Q12186 MTO1YGL236C 2010 nt7.78□□□□□ -1.16
MSL5Q12186 YPS3YLR121C 1527 nt7.78□□□□□ -1.16
MSL5Q12186 ILV3YJR016C 1758 nt7.77□□□□□ -1.17
MSL5Q12186 TOS1YBR162C 1368 nt7.77□□□□□ -1.17
MSL5Q12186 TVP23YDR084C 600 nt7.77□□□□□ -1.17
MSL5Q12186 PCP1YGR101W 1041 nt7.77□□□□□ -1.17
MSL5Q12186 MOB1YIL106W 945 nt7.77□□□□□ -1.17
MSL5Q12186 BET2YPR176C 978 nt7.77□□□□□ -1.17
MSL5Q12186 SFL1YOR140W 2301 nt7.77□□□□□ -1.17
MSL5Q12186 ADE8YDR408C 645 nt7.76□□□□□ -1.17
MSL5Q12186 ZRT3YKL175W 1512 nt7.76□□□□□ -1.17
MSL5Q12186 HEM13YDR044W 987 nt7.75□□□□□ -1.17
MSL5Q12186 THI6YPL214C 1623 nt7.74□□□□□ -1.17
MSL5Q12186 FMS1YMR020W 1527 nt7.74□□□□□ -1.17
MSL5Q12186 RTG2YGL252C 1767 nt7.74□□□□□ -1.17
MSL5Q12186 YDR455CYDR455C 309 nt7.73□□□□□ -1.17
MSL5Q12186 EDC2YER035W 438 nt7.72□□□□□ -1.17
MSL5Q12186 HOG1YLR113W 1308 nt7.72□□□□□ -1.17
MSL5Q12186 TAT2YOL020W 1779 nt7.71□□□□□ -1.17
MSL5Q12186 SNU66YOR308C 1764 nt7.71□□□□□ -1.17
MSL5Q12186 ALR1YOL130W 2580 nt7.71□□□□□ -1.17
MSL5Q12186 DUR3YHL016C 2208 nt7.71□□□□□ -1.17
MSL5Q12186 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.7□□□□□ -1.18
MSL5Q12186 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.7□□□□□ -1.18
MSL5Q12186 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.7□□□□□ -1.18
MSL5Q12186 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.7□□□□□ -1.18
MSL5Q12186 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.7□□□□□ -1.18
MSL5Q12186 SPT20YOL148C 1815 nt7.7□□□□□ -1.18
MSL5Q12186 HXK1YFR053C 1458 nt7.69□□□□□ -1.18
MSL5Q12186 GCD11YER025W 1584 nt7.69□□□□□ -1.18
MSL5Q12186 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt7.69□□□□□ -1.18
MSL5Q12186 YGR210CYGR210C 1236 nt7.69□□□□□ -1.18
MSL5Q12186 SRP102YKL154W 735 nt7.69□□□□□ -1.18
MSL5Q12186 SPP2YOR148C 558 nt7.69□□□□□ -1.18
MSL5Q12186 DIG1YPL049C 1359 nt7.69□□□□□ -1.18
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