Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 RRT8YOL048C 1029 nt8.45□□□□□ -1.06
NMD4Q12129 IML3YBR107C 738 nt8.45□□□□□ -1.06
NMD4Q12129 SGA1YIL099W 1650 nt8.45□□□□□ -1.06
NMD4Q12129 YDR306CYDR306C 1437 nt8.45□□□□□ -1.06
NMD4Q12129 CPD1YGR247W 720 nt8.44□□□□□ -1.06
NMD4Q12129 TAF13YML098W 504 nt8.44□□□□□ -1.06
NMD4Q12129 YPR126CYPR126C 309 nt8.44□□□□□ -1.06
NMD4Q12129 GID8YMR135C 1368 nt8.43□□□□□ -1.06
NMD4Q12129 UGP1YKL035W 1500 nt8.43□□□□□ -1.06
NMD4Q12129 TPO4YOR273C 1980 nt8.42□□□□□ -1.06
NMD4Q12129 ADH7YCR105W 1086 nt8.42□□□□□ -1.06
NMD4Q12129 ADE8YDR408C 645 nt8.42□□□□□ -1.06
NMD4Q12129 CTI6YPL181W 1521 nt8.42□□□□□ -1.06
NMD4Q12129 ESBP6YNL125C 2022 nt8.41□□□□□ -1.06
NMD4Q12129 HEM14YER014W 1620 nt8.4□□□□□ -1.06
NMD4Q12129 RAD51YER095W 1203 nt8.39□□□□□ -1.07
NMD4Q12129 PAU15YIR041W 375 nt8.39□□□□□ -1.07
NMD4Q12129 YJR114WYJR114W 393 nt8.39□□□□□ -1.07
NMD4Q12129 MHF1YOL086W-A 273 nt8.39□□□□□ -1.07
NMD4Q12129 PUS7YOR243C 2031 nt8.39□□□□□ -1.07
NMD4Q12129 YHL008CYHL008C 1884 nt8.38□□□□□ -1.07
NMD4Q12129 YKL133CYKL133C 1392 nt8.38□□□□□ -1.07
NMD4Q12129 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt8.38□□□□□ -1.07
NMD4Q12129 DLD3YEL071W 1491 nt8.38□□□□□ -1.07
NMD4Q12129 SPS100YHR139C 981 nt8.37□□□□□ -1.07
NMD4Q12129 SAC7YDR389W 1965 nt8.36□□□□□ -1.07
NMD4Q12129 POT1YIL160C 1254 nt8.36□□□□□ -1.07
NMD4Q12129 MRS6YOR370C 1812 nt8.35□□□□□ -1.07
NMD4Q12129 TVP23YDR084C 600 nt8.34□□□□□ -1.07
NMD4Q12129 TIP1YBR067C 633 nt8.34□□□□□ -1.07
NMD4Q12129 ITR2YOL103W 1830 nt8.33□□□□□ -1.08
NMD4Q12129 YHR219WYHR219W 1875 nt8.33□□□□□ -1.08
NMD4Q12129 YNR064CYNR064C 873 nt8.33□□□□□ -1.08
NMD4Q12129 MET8YBR213W 825 nt8.33□□□□□ -1.08
NMD4Q12129 ZAP1YJL056C 2643 nt8.33□□□□□ -1.08
NMD4Q12129 YMR262WYMR262W 942 nt8.32□□□□□ -1.08
NMD4Q12129 OPI3YJR073C 621 nt8.31□□□□□ -1.08
NMD4Q12129 LSR1LSR1 1175 nt8.31□□□□□ -1.08
NMD4Q12129 PSD1YNL169C 1503 nt8.3□□□□□ -1.08
NMD4Q12129 ABZ2YMR289W 1125 nt8.3□□□□□ -1.08
NMD4Q12129 RPD3YNL330C 1302 nt8.29□□□□□ -1.08
NMD4Q12129 ELO1YJL196C 933 nt8.29□□□□□ -1.08
NMD4Q12129 VMA11YPL234C 495 nt8.29□□□□□ -1.08
NMD4Q12129 ENO2YHR174W 1314 nt8.29□□□□□ -1.08
NMD4Q12129 GSF2YML048W 1212 nt8.28□□□□□ -1.08
NMD4Q12129 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt8.27□□□□□ -1.09
NMD4Q12129 KEL3YPL263C 1956 nt8.26□□□□□ -1.09
NMD4Q12129 PAU5YFL020C 369 nt8.26□□□□□ -1.09
NMD4Q12129 TIM44YIL022W 1296 nt8.26□□□□□ -1.09
NMD4Q12129 ILV2YMR108W 2064 nt8.25□□□□□ -1.09
NMD4Q12129 TUB4YLR212C 1422 nt8.24□□□□□ -1.09
NMD4Q12129 SNX3YOR357C 489 nt8.24□□□□□ -1.09
NMD4Q12129 SSL2YIL143C 2532 nt8.24□□□□□ -1.09
NMD4Q12129 DTR1YBR180W 1719 nt8.23□□□□□ -1.09
NMD4Q12129 DMA2YNL116W 1569 nt8.23□□□□□ -1.09
NMD4Q12129 RPN14YGL004C 1254 nt8.23□□□□□ -1.09
NMD4Q12129 CYT1YOR065W 930 nt8.23□□□□□ -1.09
NMD4Q12129 ODC1YPL134C 933 nt8.23□□□□□ -1.09
NMD4Q12129 AMF1YOR378W 1548 nt8.23□□□□□ -1.09
NMD4Q12129 YMR265CYMR265C 1386 nt8.22□□□□□ -1.09
NMD4Q12129 ESS1YJR017C 513 nt8.22□□□□□ -1.09
NMD4Q12129 CWP2YKL096W-A 279 nt8.22□□□□□ -1.09
NMD4Q12129 KRE1YNL322C 942 nt8.22□□□□□ -1.09
NMD4Q12129 HAP5YOR358W 729 nt8.22□□□□□ -1.09
NMD4Q12129 URA8YJR103W 1737 nt8.22□□□□□ -1.09
NMD4Q12129 RFC1YOR217W 2586 nt8.21□□□□□ -1.09
NMD4Q12129 PCP1YGR101W 1041 nt8.21□□□□□ -1.1
NMD4Q12129 STP3YLR375W 1032 nt8.21□□□□□ -1.1
NMD4Q12129 snR31snR31 225 nt8.21□□□□□ -1.1
NMD4Q12129 APS2YJR058C 444 nt8.2□□□□□ -1.1
NMD4Q12129 SUV3YPL029W 2214 nt8.19□□□□□ -1.1
NMD4Q12129 NIF3YGL221C 867 nt8.19□□□□□ -1.1
NMD4Q12129 TPC1YGR096W 945 nt8.19□□□□□ -1.1
NMD4Q12129 PGC1YPL206C 966 nt8.19□□□□□ -1.1
NMD4Q12129 YHR218WYHR218W 1812 nt8.19□□□□□ -1.1
NMD4Q12129 KRR1YCL059C 951 nt8.18□□□□□ -1.1
NMD4Q12129 HXK1YFR053C 1458 nt8.16□□□□□ -1.1
NMD4Q12129 SWT21YNL187W 1074 nt8.16□□□□□ -1.1
NMD4Q12129 SPE2YOL052C 1191 nt8.16□□□□□ -1.1
NMD4Q12129 SFL1YOR140W 2301 nt8.16□□□□□ -1.1
NMD4Q12129 LEU2YCL018W 1095 nt8.16□□□□□ -1.1
NMD4Q12129 MET1YKR069W 1782 nt8.15□□□□□ -1.1
NMD4Q12129 PAR32YDL173W 888 nt8.15□□□□□ -1.1
NMD4Q12129 MDM35YKL053C-A 261 nt8.15□□□□□ -1.1
NMD4Q12129 RPC31YNL151C 756 nt8.15□□□□□ -1.1
NMD4Q12129 GNP1YDR508C 1992 nt8.15□□□□□ -1.11
NMD4Q12129 CRC1YOR100C 984 nt8.14□□□□□ -1.11
NMD4Q12129 PAB1YER165W 1734 nt8.14□□□□□ -1.11
NMD4Q12129 ALD5YER073W 1563 nt8.14□□□□□ -1.11
NMD4Q12129 YRF1-2YER190W 5046 nt8.13□□□□□ -1.11
NMD4Q12129 YBR232CYBR232C 360 nt8.12□□□□□ -1.11
NMD4Q12129 YKL053WYKL053W 375 nt8.11□□□□□ -1.11
NMD4Q12129 NAM8YHR086W 1572 nt8.1□□□□□ -1.11
NMD4Q12129 RIM2YBR192W 1134 nt8.1□□□□□ -1.11
NMD4Q12129 THP3YPR045C 1413 nt8.09□□□□□ -1.11
NMD4Q12129 IGD1YFR017C 588 nt8.08□□□□□ -1.12
NMD4Q12129 NAS2YIL007C 663 nt8.08□□□□□ -1.12
NMD4Q12129 DPL1YDR294C 1770 nt8.07□□□□□ -1.12
NMD4Q12129 SEN2YLR105C 1134 nt8.07□□□□□ -1.12
NMD4Q12129 FSH2YMR222C 672 nt8.07□□□□□ -1.12
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