Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC15Q0P6D6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC15Q0P6D6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC15Q0P6D6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC15Q0P6D6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC15Q0P6D6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC15Q0P6D6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC15Q0P6D6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC15Q0P6D6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC15Q0P6D6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC15Q0P6D6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC15Q0P6D6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC15Q0P6D6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC15Q0P6D6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC15Q0P6D6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC15Q0P6D6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC15Q0P6D6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC15Q0P6D6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC15Q0P6D6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC15Q0P6D6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC15Q0P6D6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC15Q0P6D6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC15Q0P6D6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC15Q0P6D6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC15Q0P6D6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC15Q0P6D6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC15Q0P6D6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC15Q0P6D6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC15Q0P6D6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC15Q0P6D6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC15Q0P6D6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC15Q0P6D6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC15Q0P6D6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC15Q0P6D6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC15Q0P6D6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC15Q0P6D6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC15Q0P6D6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC15Q0P6D6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC15Q0P6D6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC15Q0P6D6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC15Q0P6D6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC15Q0P6D6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC15Q0P6D6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC15Q0P6D6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC15Q0P6D6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC15Q0P6D6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC15Q0P6D6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC15Q0P6D6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC15Q0P6D6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC15Q0P6D6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC15Q0P6D6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC15Q0P6D6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC15Q0P6D6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC15Q0P6D6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC15Q0P6D6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC15Q0P6D6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC15Q0P6D6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC15Q0P6D6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC15Q0P6D6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC15Q0P6D6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC15Q0P6D6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC15Q0P6D6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC15Q0P6D6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC15Q0P6D6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC15Q0P6D6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC15Q0P6D6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC15Q0P6D6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC15Q0P6D6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC15Q0P6D6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC15Q0P6D6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC15Q0P6D6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC15Q0P6D6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC15Q0P6D6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC15Q0P6D6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC15Q0P6D6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC15Q0P6D6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC15Q0P6D6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC15Q0P6D6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC15Q0P6D6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC15Q0P6D6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC15Q0P6D6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC15Q0P6D6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC15Q0P6D6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC15Q0P6D6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC15Q0P6D6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC15Q0P6D6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC15Q0P6D6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC15Q0P6D6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC15Q0P6D6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC15Q0P6D6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC15Q0P6D6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC15Q0P6D6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC15Q0P6D6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC15Q0P6D6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC15Q0P6D6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC15Q0P6D6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC15Q0P6D6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC15Q0P6D6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC15Q0P6D6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC15Q0P6D6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms