Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NIPAL4Q0D2K0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NIPAL4Q0D2K0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NIPAL4Q0D2K0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NIPAL4Q0D2K0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NIPAL4Q0D2K0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NIPAL4Q0D2K0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NIPAL4Q0D2K0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NIPAL4Q0D2K0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NIPAL4Q0D2K0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NIPAL4Q0D2K0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NIPAL4Q0D2K0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NIPAL4Q0D2K0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NIPAL4Q0D2K0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NIPAL4Q0D2K0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NIPAL4Q0D2K0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NIPAL4Q0D2K0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NIPAL4Q0D2K0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NIPAL4Q0D2K0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NIPAL4Q0D2K0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NIPAL4Q0D2K0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NIPAL4Q0D2K0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NIPAL4Q0D2K0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NIPAL4Q0D2K0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NIPAL4Q0D2K0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NIPAL4Q0D2K0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NIPAL4Q0D2K0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NIPAL4Q0D2K0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NIPAL4Q0D2K0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NIPAL4Q0D2K0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NIPAL4Q0D2K0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NIPAL4Q0D2K0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NIPAL4Q0D2K0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NIPAL4Q0D2K0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NIPAL4Q0D2K0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NIPAL4Q0D2K0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NIPAL4Q0D2K0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NIPAL4Q0D2K0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NIPAL4Q0D2K0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NIPAL4Q0D2K0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NIPAL4Q0D2K0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NIPAL4Q0D2K0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NIPAL4Q0D2K0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NIPAL4Q0D2K0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NIPAL4Q0D2K0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NIPAL4Q0D2K0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NIPAL4Q0D2K0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NIPAL4Q0D2K0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NIPAL4Q0D2K0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NIPAL4Q0D2K0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NIPAL4Q0D2K0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NIPAL4Q0D2K0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NIPAL4Q0D2K0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NIPAL4Q0D2K0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NIPAL4Q0D2K0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NIPAL4Q0D2K0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NIPAL4Q0D2K0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NIPAL4Q0D2K0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NIPAL4Q0D2K0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NIPAL4Q0D2K0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NIPAL4Q0D2K0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NIPAL4Q0D2K0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NIPAL4Q0D2K0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NIPAL4Q0D2K0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NIPAL4Q0D2K0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NIPAL4Q0D2K0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NIPAL4Q0D2K0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NIPAL4Q0D2K0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NIPAL4Q0D2K0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NIPAL4Q0D2K0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NIPAL4Q0D2K0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NIPAL4Q0D2K0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NIPAL4Q0D2K0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NIPAL4Q0D2K0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NIPAL4Q0D2K0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NIPAL4Q0D2K0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NIPAL4Q0D2K0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NIPAL4Q0D2K0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NIPAL4Q0D2K0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NIPAL4Q0D2K0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NIPAL4Q0D2K0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NIPAL4Q0D2K0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NIPAL4Q0D2K0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NIPAL4Q0D2K0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NIPAL4Q0D2K0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NIPAL4Q0D2K0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NIPAL4Q0D2K0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NIPAL4Q0D2K0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NIPAL4Q0D2K0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NIPAL4Q0D2K0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NIPAL4Q0D2K0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NIPAL4Q0D2K0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NIPAL4Q0D2K0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NIPAL4Q0D2K0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NIPAL4Q0D2K0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NIPAL4Q0D2K0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms