Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI6

SLC38A11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A11Q08AI6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC38A11Q08AI6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC38A11Q08AI6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC38A11Q08AI6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC38A11Q08AI6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC38A11Q08AI6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC38A11Q08AI6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC38A11Q08AI6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC38A11Q08AI6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC38A11Q08AI6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC38A11Q08AI6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC38A11Q08AI6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC38A11Q08AI6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC38A11Q08AI6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC38A11Q08AI6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC38A11Q08AI6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC38A11Q08AI6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC38A11Q08AI6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC38A11Q08AI6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC38A11Q08AI6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC38A11Q08AI6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC38A11Q08AI6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC38A11Q08AI6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC38A11Q08AI6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC38A11Q08AI6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC38A11Q08AI6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC38A11Q08AI6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC38A11Q08AI6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC38A11Q08AI6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC38A11Q08AI6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC38A11Q08AI6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC38A11Q08AI6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC38A11Q08AI6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC38A11Q08AI6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC38A11Q08AI6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC38A11Q08AI6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC38A11Q08AI6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC38A11Q08AI6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC38A11Q08AI6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC38A11Q08AI6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC38A11Q08AI6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC38A11Q08AI6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC38A11Q08AI6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC38A11Q08AI6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC38A11Q08AI6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC38A11Q08AI6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC38A11Q08AI6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC38A11Q08AI6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC38A11Q08AI6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC38A11Q08AI6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC38A11Q08AI6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC38A11Q08AI6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC38A11Q08AI6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC38A11Q08AI6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC38A11Q08AI6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC38A11Q08AI6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC38A11Q08AI6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC38A11Q08AI6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC38A11Q08AI6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC38A11Q08AI6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC38A11Q08AI6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC38A11Q08AI6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC38A11Q08AI6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC38A11Q08AI6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC38A11Q08AI6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC38A11Q08AI6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC38A11Q08AI6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC38A11Q08AI6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC38A11Q08AI6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC38A11Q08AI6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC38A11Q08AI6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC38A11Q08AI6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC38A11Q08AI6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC38A11Q08AI6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC38A11Q08AI6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC38A11Q08AI6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC38A11Q08AI6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC38A11Q08AI6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC38A11Q08AI6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC38A11Q08AI6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC38A11Q08AI6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC38A11Q08AI6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC38A11Q08AI6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC38A11Q08AI6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC38A11Q08AI6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC38A11Q08AI6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLC38A11Q08AI6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC38A11Q08AI6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC38A11Q08AI6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC38A11Q08AI6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC38A11Q08AI6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC38A11Q08AI6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC38A11Q08AI6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC38A11Q08AI6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC38A11Q08AI6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC38A11Q08AI6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC38A11Q08AI6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC38A11Q08AI6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC38A11Q08AI6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC38A11Q08AI6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms