Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PDE4DQ08499 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PDE4DQ08499 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PDE4DQ08499 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PDE4DQ08499 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PDE4DQ08499 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PDE4DQ08499 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PDE4DQ08499 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PDE4DQ08499 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PDE4DQ08499 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PDE4DQ08499 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PDE4DQ08499 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PDE4DQ08499 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PDE4DQ08499 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PDE4DQ08499 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PDE4DQ08499 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PDE4DQ08499 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PDE4DQ08499 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PDE4DQ08499 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PDE4DQ08499 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PDE4DQ08499 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PDE4DQ08499 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDE4DQ08499 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PDE4DQ08499 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PDE4DQ08499 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PDE4DQ08499 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PDE4DQ08499 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PDE4DQ08499 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PDE4DQ08499 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PDE4DQ08499 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PDE4DQ08499 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PDE4DQ08499 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PDE4DQ08499 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PDE4DQ08499 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PDE4DQ08499 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PDE4DQ08499 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PDE4DQ08499 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PDE4DQ08499 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PDE4DQ08499 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PDE4DQ08499 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PDE4DQ08499 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PDE4DQ08499 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PDE4DQ08499 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PDE4DQ08499 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PDE4DQ08499 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PDE4DQ08499 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PDE4DQ08499 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PDE4DQ08499 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PDE4DQ08499 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PDE4DQ08499 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PDE4DQ08499 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PDE4DQ08499 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PDE4DQ08499 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PDE4DQ08499 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PDE4DQ08499 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PDE4DQ08499 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PDE4DQ08499 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PDE4DQ08499 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PDE4DQ08499 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PDE4DQ08499 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PDE4DQ08499 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PDE4DQ08499 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
PDE4DQ08499 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PDE4DQ08499 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PDE4DQ08499 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PDE4DQ08499 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PDE4DQ08499 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PDE4DQ08499 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
PDE4DQ08499 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
PDE4DQ08499 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
PDE4DQ08499 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PDE4DQ08499 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PDE4DQ08499 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PDE4DQ08499 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDE4DQ08499 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDE4DQ08499 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PDE4DQ08499 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PDE4DQ08499 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDE4DQ08499 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDE4DQ08499 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDE4DQ08499 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDE4DQ08499 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PDE4DQ08499 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDE4DQ08499 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PDE4DQ08499 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PDE4DQ08499 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDE4DQ08499 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDE4DQ08499 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PDE4DQ08499 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PDE4DQ08499 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PDE4DQ08499 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PDE4DQ08499 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PDE4DQ08499 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDE4DQ08499 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDE4DQ08499 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDE4DQ08499 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PDE4DQ08499 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PDE4DQ08499 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PDE4DQ08499 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PDE4DQ08499 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms