Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPP3CAQ08209 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPP3CAQ08209 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPP3CAQ08209 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPP3CAQ08209 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPP3CAQ08209 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPP3CAQ08209 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPP3CAQ08209 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPP3CAQ08209 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPP3CAQ08209 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPP3CAQ08209 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPP3CAQ08209 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PPP3CAQ08209 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPP3CAQ08209 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPP3CAQ08209 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPP3CAQ08209 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPP3CAQ08209 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPP3CAQ08209 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPP3CAQ08209 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PPP3CAQ08209 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPP3CAQ08209 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPP3CAQ08209 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPP3CAQ08209 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPP3CAQ08209 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PPP3CAQ08209 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPP3CAQ08209 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPP3CAQ08209 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPP3CAQ08209 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPP3CAQ08209 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPP3CAQ08209 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPP3CAQ08209 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPP3CAQ08209 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PPP3CAQ08209 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPP3CAQ08209 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PPP3CAQ08209 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPP3CAQ08209 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPP3CAQ08209 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPP3CAQ08209 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPP3CAQ08209 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPP3CAQ08209 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPP3CAQ08209 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PPP3CAQ08209 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPP3CAQ08209 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPP3CAQ08209 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPP3CAQ08209 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPP3CAQ08209 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPP3CAQ08209 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPP3CAQ08209 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPP3CAQ08209 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPP3CAQ08209 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPP3CAQ08209 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PPP3CAQ08209 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PPP3CAQ08209 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PPP3CAQ08209 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPP3CAQ08209 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPP3CAQ08209 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPP3CAQ08209 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPP3CAQ08209 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPP3CAQ08209 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPP3CAQ08209 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPP3CAQ08209 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPP3CAQ08209 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPP3CAQ08209 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPP3CAQ08209 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPP3CAQ08209 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPP3CAQ08209 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP3CAQ08209 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP3CAQ08209 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP3CAQ08209 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP3CAQ08209 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPP3CAQ08209 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPP3CAQ08209 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPP3CAQ08209 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP3CAQ08209 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP3CAQ08209 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP3CAQ08209 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP3CAQ08209 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
PPP3CAQ08209 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP3CAQ08209 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP3CAQ08209 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP3CAQ08209 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP3CAQ08209 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPP3CAQ08209 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPP3CAQ08209 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPP3CAQ08209 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PPP3CAQ08209 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPP3CAQ08209 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPP3CAQ08209 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPP3CAQ08209 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPP3CAQ08209 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPP3CAQ08209 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPP3CAQ08209 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPP3CAQ08209 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP3CAQ08209 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP3CAQ08209 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP3CAQ08209 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPP3CAQ08209 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PPP3CAQ08209 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP3CAQ08209 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP3CAQ08209 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.9 ms