Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRSF4Q08170 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRSF4Q08170 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRSF4Q08170 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRSF4Q08170 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRSF4Q08170 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRSF4Q08170 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRSF4Q08170 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRSF4Q08170 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRSF4Q08170 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRSF4Q08170 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRSF4Q08170 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRSF4Q08170 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRSF4Q08170 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRSF4Q08170 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRSF4Q08170 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRSF4Q08170 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRSF4Q08170 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRSF4Q08170 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRSF4Q08170 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SRSF4Q08170 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRSF4Q08170 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRSF4Q08170 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SRSF4Q08170 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SRSF4Q08170 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRSF4Q08170 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRSF4Q08170 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRSF4Q08170 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRSF4Q08170 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRSF4Q08170 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRSF4Q08170 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRSF4Q08170 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF4Q08170 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF4Q08170 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF4Q08170 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF4Q08170 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF4Q08170 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRSF4Q08170 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRSF4Q08170 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRSF4Q08170 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRSF4Q08170 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRSF4Q08170 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRSF4Q08170 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRSF4Q08170 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRSF4Q08170 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRSF4Q08170 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRSF4Q08170 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRSF4Q08170 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF4Q08170 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF4Q08170 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF4Q08170 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF4Q08170 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF4Q08170 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF4Q08170 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF4Q08170 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF4Q08170 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF4Q08170 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRSF4Q08170 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRSF4Q08170 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRSF4Q08170 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SRSF4Q08170 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF4Q08170 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF4Q08170 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF4Q08170 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRSF4Q08170 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRSF4Q08170 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRSF4Q08170 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRSF4Q08170 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SRSF4Q08170 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRSF4Q08170 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRSF4Q08170 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRSF4Q08170 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRSF4Q08170 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRSF4Q08170 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRSF4Q08170 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRSF4Q08170 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRSF4Q08170 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRSF4Q08170 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRSF4Q08170 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRSF4Q08170 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SRSF4Q08170 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRSF4Q08170 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRSF4Q08170 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRSF4Q08170 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SRSF4Q08170 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRSF4Q08170 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRSF4Q08170 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SRSF4Q08170 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRSF4Q08170 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRSF4Q08170 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRSF4Q08170 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRSF4Q08170 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SRSF4Q08170 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRSF4Q08170 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRSF4Q08170 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRSF4Q08170 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRSF4Q08170 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRSF4Q08170 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRSF4Q08170 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRSF4Q08170 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms