Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC3A1Q07837 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC3A1Q07837 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC3A1Q07837 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC3A1Q07837 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC3A1Q07837 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC3A1Q07837 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC3A1Q07837 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC3A1Q07837 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC3A1Q07837 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC3A1Q07837 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC3A1Q07837 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC3A1Q07837 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC3A1Q07837 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC3A1Q07837 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC3A1Q07837 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC3A1Q07837 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC3A1Q07837 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC3A1Q07837 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC3A1Q07837 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC3A1Q07837 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC3A1Q07837 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC3A1Q07837 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC3A1Q07837 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC3A1Q07837 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC3A1Q07837 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC3A1Q07837 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC3A1Q07837 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC3A1Q07837 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC3A1Q07837 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC3A1Q07837 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC3A1Q07837 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC3A1Q07837 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC3A1Q07837 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC3A1Q07837 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC3A1Q07837 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC3A1Q07837 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC3A1Q07837 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC3A1Q07837 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC3A1Q07837 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC3A1Q07837 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC3A1Q07837 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC3A1Q07837 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC3A1Q07837 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC3A1Q07837 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC3A1Q07837 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC3A1Q07837 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC3A1Q07837 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC3A1Q07837 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC3A1Q07837 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC3A1Q07837 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC3A1Q07837 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC3A1Q07837 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC3A1Q07837 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC3A1Q07837 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC3A1Q07837 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC3A1Q07837 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC3A1Q07837 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC3A1Q07837 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC3A1Q07837 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC3A1Q07837 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC3A1Q07837 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC3A1Q07837 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC3A1Q07837 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SLC3A1Q07837 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC3A1Q07837 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC3A1Q07837 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC3A1Q07837 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC3A1Q07837 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC3A1Q07837 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC3A1Q07837 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC3A1Q07837 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC3A1Q07837 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC3A1Q07837 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC3A1Q07837 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC3A1Q07837 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC3A1Q07837 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC3A1Q07837 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC3A1Q07837 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC3A1Q07837 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC3A1Q07837 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC3A1Q07837 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC3A1Q07837 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC3A1Q07837 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC3A1Q07837 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC3A1Q07837 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC3A1Q07837 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC3A1Q07837 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC3A1Q07837 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC3A1Q07837 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC3A1Q07837 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC3A1Q07837 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC3A1Q07837 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC3A1Q07837 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC3A1Q07837 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC3A1Q07837 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC3A1Q07837 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC3A1Q07837 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC3A1Q07837 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC3A1Q07837 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms