Protein–RNA interactions for Protein: Q07500

NDE2, External NADH-ubiquinone oxidoreductase 2, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NDE2Q07500 GUT1YHL032C 2130 nt7.46□□□□□ -1.21
NDE2Q07500 CCT2YIL142W 1584 nt7.46□□□□□ -1.21
NDE2Q07500 AFG2YLR397C 2343 nt7.46□□□□□ -1.21
NDE2Q07500 PRY1YJL079C 900 nt7.46□□□□□ -1.22
NDE2Q07500 HXT10YFL011W 1641 nt7.45□□□□□ -1.22
NDE2Q07500 SAM2YDR502C 1155 nt7.45□□□□□ -1.22
NDE2Q07500 YPS3YLR121C 1527 nt7.45□□□□□ -1.22
NDE2Q07500 FMS1YMR020W 1527 nt7.45□□□□□ -1.22
NDE2Q07500 ACH1YBL015W 1581 nt7.45□□□□□ -1.22
NDE2Q07500 HBS1YKR084C 1836 nt7.45□□□□□ -1.22
NDE2Q07500 FLR1YBR008C 1647 nt7.45□□□□□ -1.22
NDE2Q07500 YPI1YFR003C 468 nt7.44□□□□□ -1.22
NDE2Q07500 LOT5YKL183W 921 nt7.44□□□□□ -1.22
NDE2Q07500 CSM1YCR086W 573 nt7.43□□□□□ -1.22
NDE2Q07500 SMM1YNR015W 1155 nt7.43□□□□□ -1.22
NDE2Q07500 DUS3YLR401C 2007 nt7.43□□□□□ -1.22
NDE2Q07500 HXT12YIL170W 1374 nt7.43□□□□□ -1.22
NDE2Q07500 BNI5YNL166C 1347 nt7.42□□□□□ -1.22
NDE2Q07500 YIL108WYIL108W 2091 nt7.42□□□□□ -1.22
NDE2Q07500 DLD2YDL178W 1593 nt7.42□□□□□ -1.22
NDE2Q07500 STF1YDL130W-A 261 nt7.41□□□□□ -1.22
NDE2Q07500 YER188WYER188W 720 nt7.41□□□□□ -1.22
NDE2Q07500 SPP2YOR148C 558 nt7.41□□□□□ -1.22
NDE2Q07500 NME1NME1 340 nt7.41□□□□□ -1.22
NDE2Q07500 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.4□□□□□ -1.22
NDE2Q07500 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.4□□□□□ -1.22
NDE2Q07500 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.4□□□□□ -1.22
NDE2Q07500 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.4□□□□□ -1.22
NDE2Q07500 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.4□□□□□ -1.22
NDE2Q07500 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.4□□□□□ -1.22
NDE2Q07500 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.4□□□□□ -1.22
NDE2Q07500 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.4□□□□□ -1.22
NDE2Q07500 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.4□□□□□ -1.22
NDE2Q07500 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.4□□□□□ -1.22
NDE2Q07500 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.4□□□□□ -1.22
NDE2Q07500 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.4□□□□□ -1.22
NDE2Q07500 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.4□□□□□ -1.22
NDE2Q07500 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.4□□□□□ -1.22
NDE2Q07500 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.4□□□□□ -1.22
NDE2Q07500 POP2YNR052C 1302 nt7.39□□□□□ -1.23
NDE2Q07500 FUB1YCR076C 753 nt7.39□□□□□ -1.23
NDE2Q07500 LSB3YFR024C-A 1380 nt7.38□□□□□ -1.23
NDE2Q07500 TOP3YLR234W 1971 nt7.38□□□□□ -1.23
NDE2Q07500 VPS62YGR141W 1404 nt7.37□□□□□ -1.23
NDE2Q07500 LSB6YJL100W 1824 nt7.37□□□□□ -1.23
NDE2Q07500 YDL086WYDL086W 822 nt7.37□□□□□ -1.23
NDE2Q07500 NUC1YJL208C 990 nt7.37□□□□□ -1.23
NDE2Q07500 SAM3YPL274W 1764 nt7.36□□□□□ -1.23
NDE2Q07500 HEM13YDR044W 987 nt7.36□□□□□ -1.23
NDE2Q07500 MDM35YKL053C-A 261 nt7.36□□□□□ -1.23
NDE2Q07500 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.36□□□□□ -1.23
NDE2Q07500 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.36□□□□□ -1.23
NDE2Q07500 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.36□□□□□ -1.23
NDE2Q07500 YNR029CYNR029C 1290 nt7.35□□□□□ -1.23
NDE2Q07500 ADH1YOL086C 1047 nt7.35□□□□□ -1.23
NDE2Q07500 MET1YKR069W 1782 nt7.34□□□□□ -1.23
NDE2Q07500 YJL118WYJL118W 660 nt7.34□□□□□ -1.23
NDE2Q07500 RPT5YOR117W 1305 nt7.33□□□□□ -1.24
NDE2Q07500 AIM34YMR003W 597 nt7.33□□□□□ -1.24
NDE2Q07500 MSB3YNL293W 1902 nt7.32□□□□□ -1.24
NDE2Q07500 PUS7YOR243C 2031 nt7.32□□□□□ -1.24
NDE2Q07500 OSH7YHR001W 1314 nt7.31□□□□□ -1.24
NDE2Q07500 VRG4YGL225W 1014 nt7.31□□□□□ -1.24
NDE2Q07500 HXT13YEL069C 1695 nt7.31□□□□□ -1.24
NDE2Q07500 AGP3YFL055W 1677 nt7.31□□□□□ -1.24
NDE2Q07500 ADE16YLR028C 1776 nt7.3□□□□□ -1.24
NDE2Q07500 ITR1YDR497C 1755 nt7.29□□□□□ -1.24
NDE2Q07500 OYE2YHR179W 1203 nt7.29□□□□□ -1.24
NDE2Q07500 EAF3YPR023C 1206 nt7.28□□□□□ -1.24
NDE2Q07500 RIB7YBR153W 735 nt7.28□□□□□ -1.24
NDE2Q07500 YJL045WYJL045W 1905 nt7.28□□□□□ -1.24
NDE2Q07500 CMK2YOL016C 1344 nt7.27□□□□□ -1.24
NDE2Q07500 FUN14YAL008W 597 nt7.27□□□□□ -1.25
NDE2Q07500 YJL195CYJL195C 702 nt7.27□□□□□ -1.25
NDE2Q07500 RAS2YNL098C 969 nt7.27□□□□□ -1.25
NDE2Q07500 DIG1YPL049C 1359 nt7.27□□□□□ -1.25
NDE2Q07500 GAL3YDR009W 1563 nt7.27□□□□□ -1.25
NDE2Q07500 RIB2YOL066C 1776 nt7.27□□□□□ -1.25
NDE2Q07500 BAP3YDR046C 1815 nt7.27□□□□□ -1.25
NDE2Q07500 GID8YMR135C 1368 nt7.26□□□□□ -1.25
NDE2Q07500 YJL055WYJL055W 738 nt7.26□□□□□ -1.25
NDE2Q07500 GPN2YOR262W 1044 nt7.26□□□□□ -1.25
NDE2Q07500 YNL040WYNL040W 1371 nt7.24□□□□□ -1.25
NDE2Q07500 ENT4YLL038C 744 nt7.24□□□□□ -1.25
NDE2Q07500 TAT2YOL020W 1779 nt7.23□□□□□ -1.25
NDE2Q07500 PFS2YNL317W 1398 nt7.23□□□□□ -1.25
NDE2Q07500 CDC13YDL220C 2775 nt7.23□□□□□ -1.25
NDE2Q07500 SOL2YCR073W-A 948 nt7.23□□□□□ -1.25
NDE2Q07500 ATP10YLR393W 840 nt7.22□□□□□ -1.25
NDE2Q07500 HEL1YKR017C 1656 nt7.22□□□□□ -1.25
NDE2Q07500 YEL008WYEL008W 381 nt7.21□□□□□ -1.26
NDE2Q07500 ASP3-1YLR155C 1089 nt7.21□□□□□ -1.26
NDE2Q07500 ASP3-2YLR157C 1089 nt7.21□□□□□ -1.26
NDE2Q07500 ASP3-3YLR158C 1089 nt7.21□□□□□ -1.26
NDE2Q07500 ASP3-4YLR160C 1089 nt7.21□□□□□ -1.26
NDE2Q07500 ADH6YMR318C 1083 nt7.21□□□□□ -1.26
NDE2Q07500 RRT8YOL048C 1029 nt7.21□□□□□ -1.26
NDE2Q07500 TPS1YBR126C 1488 nt7.21□□□□□ -1.26
NDE2Q07500 YKL133CYKL133C 1392 nt7.2□□□□□ -1.26
NDE2Q07500 MRS6YOR370C 1812 nt7.2□□□□□ -1.26
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