Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PDE4BQ07343 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PDE4BQ07343 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PDE4BQ07343 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PDE4BQ07343 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PDE4BQ07343 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PDE4BQ07343 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PDE4BQ07343 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PDE4BQ07343 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PDE4BQ07343 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PDE4BQ07343 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PDE4BQ07343 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PDE4BQ07343 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PDE4BQ07343 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.58
PDE4BQ07343 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
PDE4BQ07343 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PDE4BQ07343 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
PDE4BQ07343 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PDE4BQ07343 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PDE4BQ07343 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
PDE4BQ07343 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PDE4BQ07343 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
PDE4BQ07343 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PDE4BQ07343 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PDE4BQ07343 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PDE4BQ07343 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PDE4BQ07343 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PDE4BQ07343 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PDE4BQ07343 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PDE4BQ07343 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PDE4BQ07343 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PDE4BQ07343 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PDE4BQ07343 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PDE4BQ07343 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PDE4BQ07343 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PDE4BQ07343 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
PDE4BQ07343 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PDE4BQ07343 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PDE4BQ07343 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
PDE4BQ07343 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PDE4BQ07343 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PDE4BQ07343 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PDE4BQ07343 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PDE4BQ07343 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PDE4BQ07343 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PDE4BQ07343 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PDE4BQ07343 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PDE4BQ07343 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PDE4BQ07343 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PDE4BQ07343 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PDE4BQ07343 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PDE4BQ07343 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PDE4BQ07343 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PDE4BQ07343 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PDE4BQ07343 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PDE4BQ07343 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
PDE4BQ07343 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PDE4BQ07343 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PDE4BQ07343 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PDE4BQ07343 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PDE4BQ07343 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PDE4BQ07343 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
PDE4BQ07343 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
PDE4BQ07343 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PDE4BQ07343 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PDE4BQ07343 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PDE4BQ07343 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PDE4BQ07343 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PDE4BQ07343 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PDE4BQ07343 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PDE4BQ07343 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PDE4BQ07343 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PDE4BQ07343 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PDE4BQ07343 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PDE4BQ07343 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PDE4BQ07343 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PDE4BQ07343 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PDE4BQ07343 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PDE4BQ07343 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PDE4BQ07343 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PDE4BQ07343 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PDE4BQ07343 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PDE4BQ07343 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PDE4BQ07343 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PDE4BQ07343 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PDE4BQ07343 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PDE4BQ07343 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PDE4BQ07343 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
PDE4BQ07343 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PDE4BQ07343 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PDE4BQ07343 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PDE4BQ07343 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PDE4BQ07343 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PDE4BQ07343 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PDE4BQ07343 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PDE4BQ07343 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PDE4BQ07343 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PDE4BQ07343 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PDE4BQ07343 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PDE4BQ07343 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms