Protein–RNA interactions for Protein: Q06623

HDA3, HDA1 complex subunit 3, yeastyeast

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3Q06623 YER147C-AYER147C-A 411 nt9.21□□□□□ -0.94
HDA3Q06623 ILV3YJR016C 1758 nt9.2□□□□□ -0.94
HDA3Q06623 YNL024CYNL024C 741 nt9.2□□□□□ -0.94
HDA3Q06623 HEL2YDR266C 1920 nt9.2□□□□□ -0.94
HDA3Q06623 PUS7YOR243C 2031 nt9.2□□□□□ -0.94
HDA3Q06623 BSP1YPR171W 1731 nt9.19□□□□□ -0.94
HDA3Q06623 SAM2YDR502C 1155 nt9.19□□□□□ -0.94
HDA3Q06623 CTR1YPR124W 1221 nt9.19□□□□□ -0.94
HDA3Q06623 NEM1YHR004C 1341 nt9.19□□□□□ -0.94
HDA3Q06623 STD1YOR047C 1335 nt9.19□□□□□ -0.94
HDA3Q06623 YDR306CYDR306C 1437 nt9.19□□□□□ -0.94
HDA3Q06623 MUP1YGR055W 1725 nt9.19□□□□□ -0.94
HDA3Q06623 RAD23YEL037C 1197 nt9.18□□□□□ -0.94
HDA3Q06623 FMS1YMR020W 1527 nt9.18□□□□□ -0.94
HDA3Q06623 PRE2YPR103W 864 nt9.18□□□□□ -0.94
HDA3Q06623 YCR049CYCR049C 447 nt9.17□□□□□ -0.94
HDA3Q06623 CAB5YDR196C 726 nt9.17□□□□□ -0.94
HDA3Q06623 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt9.17□□□□□ -0.94
HDA3Q06623 HOL1YNR055C 1761 nt9.17□□□□□ -0.94
HDA3Q06623 FLR1YBR008C 1647 nt9.16□□□□□ -0.94
HDA3Q06623 FCY21YER060W 1587 nt9.16□□□□□ -0.94
HDA3Q06623 SPP2YOR148C 558 nt9.16□□□□□ -0.94
HDA3Q06623 MRI1YPR118W 1236 nt9.16□□□□□ -0.94
HDA3Q06623 SSN3YPL042C 1668 nt9.16□□□□□ -0.94
HDA3Q06623 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt9.15□□□□□ -0.94
HDA3Q06623 UBC12YLR306W 567 nt9.15□□□□□ -0.94
HDA3Q06623 YLR311CYLR311C 348 nt9.15□□□□□ -0.94
HDA3Q06623 MIX17YMR002W 471 nt9.15□□□□□ -0.94
HDA3Q06623 KTR3YBR205W 1215 nt9.15□□□□□ -0.94
HDA3Q06623 RSC8YFR037C 1674 nt9.15□□□□□ -0.94
HDA3Q06623 YLR460CYLR460C 1131 nt9.14□□□□□ -0.95
HDA3Q06623 SEC61YLR378C 1443 nt9.14□□□□□ -0.95
HDA3Q06623 YNL040WYNL040W 1371 nt9.13□□□□□ -0.95
HDA3Q06623 ACH1YBL015W 1581 nt9.13□□□□□ -0.95
HDA3Q06623 APT2YDR441C 546 nt9.13□□□□□ -0.95
HDA3Q06623 MPS2YGL075C 1164 nt9.13□□□□□ -0.95
HDA3Q06623 LYS12YIL094C 1116 nt9.13□□□□□ -0.95
HDA3Q06623 COX3Q0275 810 nt9.13□□□□□ -0.95
HDA3Q06623 ARC19YKL013C 516 nt9.13□□□□□ -0.95
HDA3Q06623 YPS3YLR121C 1527 nt9.13□□□□□ -0.95
HDA3Q06623 DLD2YDL178W 1593 nt9.12□□□□□ -0.95
HDA3Q06623 CCT2YIL142W 1584 nt9.12□□□□□ -0.95
HDA3Q06623 BNI5YNL166C 1347 nt9.12□□□□□ -0.95
HDA3Q06623 OPI10YOL032W 741 nt9.12□□□□□ -0.95
HDA3Q06623 DSE3YOR264W 1293 nt9.12□□□□□ -0.95
HDA3Q06623 NPL6YMR091C 1308 nt9.11□□□□□ -0.95
HDA3Q06623 RIB3YDR487C 627 nt9.11□□□□□ -0.95
HDA3Q06623 OXA1YER154W 1209 nt9.11□□□□□ -0.95
HDA3Q06623 PEX12YMR026C 1200 nt9.11□□□□□ -0.95
HDA3Q06623 AIR1YIL079C 1083 nt9.1□□□□□ -0.95
HDA3Q06623 TIF34YMR146C 1044 nt9.1□□□□□ -0.95
HDA3Q06623 SVF1YDR346C 1446 nt9.09□□□□□ -0.95
HDA3Q06623 YMR210WYMR210W 1350 nt9.09□□□□□ -0.95
HDA3Q06623 PRY1YJL079C 900 nt9.08□□□□□ -0.96
HDA3Q06623 YMR114CYMR114C 1107 nt9.08□□□□□ -0.96
HDA3Q06623 PHO23YNL097C 993 nt9.08□□□□□ -0.96
HDA3Q06623 SMM1YNR015W 1155 nt9.08□□□□□ -0.96
HDA3Q06623 MSC1YML128C 1542 nt9.07□□□□□ -0.96
HDA3Q06623 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt9.07□□□□□ -0.96
HDA3Q06623 MET2YNL277W 1461 nt9.07□□□□□ -0.96
HDA3Q06623 VPS62YGR141W 1404 nt9.06□□□□□ -0.96
HDA3Q06623 NUP57YGR119C 1626 nt9.06□□□□□ -0.96
HDA3Q06623 CSM1YCR086W 573 nt9.06□□□□□ -0.96
HDA3Q06623 YER188WYER188W 720 nt9.06□□□□□ -0.96
HDA3Q06623 GND1YHR183W 1470 nt9.06□□□□□ -0.96
HDA3Q06623 ARO8YGL202W 1503 nt9.05□□□□□ -0.96
HDA3Q06623 RIM8YGL045W 1629 nt9.05□□□□□ -0.96
HDA3Q06623 FUB1YCR076C 753 nt9.05□□□□□ -0.96
HDA3Q06623 HEM13YDR044W 987 nt9.05□□□□□ -0.96
HDA3Q06623 BET2YPR176C 978 nt9.05□□□□□ -0.96
HDA3Q06623 AME1YBR211C 975 nt9.05□□□□□ -0.96
HDA3Q06623 MCM5YLR274W 2328 nt9.05□□□□□ -0.96
HDA3Q06623 COQ8YGL119W 1506 nt9.05□□□□□ -0.96
HDA3Q06623 LSB6YJL100W 1824 nt9.04□□□□□ -0.96
HDA3Q06623 YDL157CYDL157C 357 nt9.04□□□□□ -0.96
HDA3Q06623 RAI1YGL246C 1164 nt9.04□□□□□ -0.96
HDA3Q06623 YMR074CYMR074C 438 nt9.04□□□□□ -0.96
HDA3Q06623 LOT5YKL183W 921 nt9.03□□□□□ -0.96
HDA3Q06623 PEX27YOR193W 1131 nt9.03□□□□□ -0.96
HDA3Q06623 YJR056CYJR056C 711 nt9.02□□□□□ -0.97
HDA3Q06623 DIA1YMR316W 1011 nt9.02□□□□□ -0.97
HDA3Q06623 YDL086WYDL086W 822 nt9.01□□□□□ -0.97
HDA3Q06623 NUC1YJL208C 990 nt9.01□□□□□ -0.97
HDA3Q06623 PEX34YCL056C 435 nt9.01□□□□□ -0.97
HDA3Q06623 NEJ1YLR265C 1029 nt9□□□□□ -0.97
HDA3Q06623 KES1YPL145C 1305 nt9□□□□□ -0.97
HDA3Q06623 COS6YGR295C 1146 nt8.99□□□□□ -0.97
HDA3Q06623 YHR145CYHR145C 357 nt8.99□□□□□ -0.97
HDA3Q06623 RAS2YNL098C 969 nt8.99□□□□□ -0.97
HDA3Q06623 snR34snR34 203 nt8.99□□□□□ -0.97
HDA3Q06623 OSH7YHR001W 1314 nt8.99□□□□□ -0.97
HDA3Q06623 YGL114WYGL114W 2178 nt8.99□□□□□ -0.97
HDA3Q06623 VPS28YPL065W 729 nt8.98□□□□□ -0.97
HDA3Q06623 LSB5YCL034W 1065 nt8.97□□□□□ -0.97
HDA3Q06623 SAM3YPL274W 1764 nt8.96□□□□□ -0.97
HDA3Q06623 UGP1YKL035W 1500 nt8.96□□□□□ -0.97
HDA3Q06623 QDR2YIL121W 1629 nt8.96□□□□□ -0.98
HDA3Q06623 YLR283WYLR283W 945 nt8.96□□□□□ -0.98
HDA3Q06623 SGA1YIL099W 1650 nt8.96□□□□□ -0.98
HDA3Q06623 GID7YCL039W 2238 nt8.96□□□□□ -0.98
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