Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GABPAQ06546 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
GABPAQ06546 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GABPAQ06546 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
GABPAQ06546 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
GABPAQ06546 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GABPAQ06546 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GABPAQ06546 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GABPAQ06546 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GABPAQ06546 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GABPAQ06546 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GABPAQ06546 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GABPAQ06546 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GABPAQ06546 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
GABPAQ06546 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.2■■■□□ 2.59
GABPAQ06546 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
GABPAQ06546 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GABPAQ06546 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GABPAQ06546 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GABPAQ06546 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GABPAQ06546 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GABPAQ06546 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GABPAQ06546 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GABPAQ06546 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
GABPAQ06546 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GABPAQ06546 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
GABPAQ06546 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
GABPAQ06546 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GABPAQ06546 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
GABPAQ06546 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GABPAQ06546 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GABPAQ06546 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
GABPAQ06546 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GABPAQ06546 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
GABPAQ06546 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
GABPAQ06546 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
GABPAQ06546 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
GABPAQ06546 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
GABPAQ06546 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
GABPAQ06546 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GABPAQ06546 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
GABPAQ06546 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
GABPAQ06546 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GABPAQ06546 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
GABPAQ06546 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
GABPAQ06546 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
GABPAQ06546 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
GABPAQ06546 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
GABPAQ06546 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
GABPAQ06546 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
GABPAQ06546 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GABPAQ06546 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
GABPAQ06546 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
GABPAQ06546 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
GABPAQ06546 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
GABPAQ06546 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GABPAQ06546 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
GABPAQ06546 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
GABPAQ06546 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31■■■□□ 2.55
GABPAQ06546 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GABPAQ06546 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GABPAQ06546 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GABPAQ06546 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
GABPAQ06546 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GABPAQ06546 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GABPAQ06546 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GABPAQ06546 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
GABPAQ06546 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
GABPAQ06546 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
GABPAQ06546 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GABPAQ06546 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GABPAQ06546 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GABPAQ06546 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.55
GABPAQ06546 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
GABPAQ06546 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GABPAQ06546 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GABPAQ06546 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GABPAQ06546 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GABPAQ06546 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GABPAQ06546 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GABPAQ06546 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GABPAQ06546 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GABPAQ06546 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GABPAQ06546 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
GABPAQ06546 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
GABPAQ06546 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
GABPAQ06546 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GABPAQ06546 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
GABPAQ06546 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
GABPAQ06546 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
GABPAQ06546 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
GABPAQ06546 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
GABPAQ06546 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
GABPAQ06546 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
GABPAQ06546 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
GABPAQ06546 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
GABPAQ06546 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GABPAQ06546 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GABPAQ06546 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GABPAQ06546 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms