Protein–RNA interactions for Protein: Q06330

RBPJ, Recombining binding protein suppressor of hairless, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBPJQ06330 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RBPJQ06330 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RBPJQ06330 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RBPJQ06330 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RBPJQ06330 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RBPJQ06330 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RBPJQ06330 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RBPJQ06330 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RBPJQ06330 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBPJQ06330 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBPJQ06330 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBPJQ06330 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBPJQ06330 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBPJQ06330 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBPJQ06330 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBPJQ06330 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBPJQ06330 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBPJQ06330 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBPJQ06330 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
RBPJQ06330 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBPJQ06330 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBPJQ06330 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RBPJQ06330 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBPJQ06330 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBPJQ06330 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBPJQ06330 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBPJQ06330 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBPJQ06330 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBPJQ06330 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBPJQ06330 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBPJQ06330 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBPJQ06330 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBPJQ06330 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBPJQ06330 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBPJQ06330 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBPJQ06330 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBPJQ06330 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBPJQ06330 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBPJQ06330 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBPJQ06330 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBPJQ06330 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBPJQ06330 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBPJQ06330 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBPJQ06330 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBPJQ06330 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBPJQ06330 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBPJQ06330 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBPJQ06330 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBPJQ06330 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBPJQ06330 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBPJQ06330 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBPJQ06330 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBPJQ06330 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBPJQ06330 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBPJQ06330 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBPJQ06330 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBPJQ06330 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBPJQ06330 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBPJQ06330 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBPJQ06330 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBPJQ06330 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBPJQ06330 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBPJQ06330 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBPJQ06330 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBPJQ06330 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBPJQ06330 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBPJQ06330 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBPJQ06330 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBPJQ06330 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBPJQ06330 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBPJQ06330 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBPJQ06330 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBPJQ06330 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBPJQ06330 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBPJQ06330 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBPJQ06330 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBPJQ06330 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBPJQ06330 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBPJQ06330 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBPJQ06330 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBPJQ06330 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBPJQ06330 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBPJQ06330 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBPJQ06330 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBPJQ06330 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBPJQ06330 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBPJQ06330 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBPJQ06330 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBPJQ06330 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBPJQ06330 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBPJQ06330 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBPJQ06330 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBPJQ06330 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBPJQ06330 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBPJQ06330 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBPJQ06330 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBPJQ06330 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBPJQ06330 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBPJQ06330 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBPJQ06330 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms