Protein–RNA interactions for Protein: Q05541

NSE3, Non-structural maintenance of chromosome element 3, yeast

Predictions only

Length 303 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NSE3	Q05541	NAS2	YIL007C	663 nt		10.83	□□□□□ -0.68
NSE3	Q05541	RPC82	YPR190C	1965 nt		10.83	□□□□□ -0.68
NSE3	Q05541	MCH5	YOR306C	1566 nt		10.82	□□□□□ -0.68
NSE3	Q05541	tA(AGC)D	tA(AGC)D	73 nt		10.81	□□□□□ -0.68
NSE3	Q05541	tA(AGC)F	tA(AGC)F	73 nt		10.81	□□□□□ -0.68
NSE3	Q05541	tA(AGC)G	tA(AGC)G	73 nt		10.81	□□□□□ -0.68
NSE3	Q05541	tA(AGC)H	tA(AGC)H	73 nt		10.81	□□□□□ -0.68
NSE3	Q05541	tA(AGC)J	tA(AGC)J	73 nt		10.81	□□□□□ -0.68
NSE3	Q05541	tA(AGC)K1	tA(AGC)K1	73 nt		10.81	□□□□□ -0.68
NSE3	Q05541	tA(AGC)K2	tA(AGC)K2	73 nt		10.81	□□□□□ -0.68
NSE3	Q05541	tA(AGC)L	tA(AGC)L	73 nt		10.81	□□□□□ -0.68
NSE3	Q05541	tA(AGC)M1	tA(AGC)M1	73 nt		10.81	□□□□□ -0.68
NSE3	Q05541	tA(AGC)M2	tA(AGC)M2	73 nt		10.81	□□□□□ -0.68
NSE3	Q05541	tA(AGC)P	tA(AGC)P	73 nt		10.81	□□□□□ -0.68
NSE3	Q05541	OPI3	YJR073C	621 nt		10.81	□□□□□ -0.68
NSE3	Q05541	SPE2	YOL052C	1191 nt		10.81	□□□□□ -0.68
NSE3	Q05541	IPL1	YPL209C	1104 nt		10.81	□□□□□ -0.68
NSE3	Q05541	CCT2	YIL142W	1584 nt		10.81	□□□□□ -0.68
NSE3	Q05541	YCR025C	YCR025C	411 nt		10.8	□□□□□ -0.68
NSE3	Q05541	ENO2	YHR174W	1314 nt		10.8	□□□□□ -0.68
NSE3	Q05541	ENT4	YLL038C	744 nt		10.79	□□□□□ -0.68
NSE3	Q05541	CDD1	YLR245C	429 nt		10.79	□□□□□ -0.68
NSE3	Q05541	RIB1	YBL033C	1038 nt		10.79	□□□□□ -0.68
NSE3	Q05541	YOR325W	YOR325W	474 nt		10.79	□□□□□ -0.68
NSE3	Q05541	Q0010	Q0010	387 nt		10.78	□□□□□ -0.68
NSE3	Q05541	THP3	YPR045C	1413 nt		10.77	□□□□□ -0.68
NSE3	Q05541	YCP4	YCR004C	744 nt		10.77	□□□□□ -0.69
NSE3	Q05541	ACO2	YJL200C	2370 nt		10.77	□□□□□ -0.69
NSE3	Q05541	ILV3	YJR016C	1758 nt		10.76	□□□□□ -0.69
NSE3	Q05541	YIA6	YIL006W	1122 nt		10.76	□□□□□ -0.69
NSE3	Q05541	OPI10	YOL032W	741 nt		10.76	□□□□□ -0.69
NSE3	Q05541	SAC7	YDR389W	1965 nt		10.75	□□□□□ -0.69
NSE3	Q05541	SAM50	YNL026W	1455 nt		10.74	□□□□□ -0.69
NSE3	Q05541	SOD2	YHR008C	702 nt		10.74	□□□□□ -0.69
NSE3	Q05541	BET2	YPR176C	978 nt		10.74	□□□□□ -0.69
NSE3	Q05541	TPC1	YGR096W	945 nt		10.73	□□□□□ -0.69
NSE3	Q05541	AMF1	YOR378W	1548 nt		10.73	□□□□□ -0.69
NSE3	Q05541	YLR046C	YLR046C	813 nt		10.72	□□□□□ -0.69
NSE3	Q05541	FSH2	YMR222C	672 nt		10.72	□□□□□ -0.69
NSE3	Q05541	UME6	YDR207C	2511 nt		10.71	□□□□□ -0.69
NSE3	Q05541	FLX1	YIL134W	936 nt		10.71	□□□□□ -0.69
NSE3	Q05541	ERG6	YML008C	1152 nt		10.71	□□□□□ -0.69
NSE3	Q05541	DIG1	YPL049C	1359 nt		10.7	□□□□□ -0.7
NSE3	Q05541	YNR064C	YNR064C	873 nt		10.7	□□□□□ -0.7
NSE3	Q05541	ADH3	YMR083W	1128 nt		10.69	□□□□□ -0.7
NSE3	Q05541	MET8	YBR213W	825 nt		10.69	□□□□□ -0.7
NSE3	Q05541	SPT20	YOL148C	1815 nt		10.69	□□□□□ -0.7
NSE3	Q05541	PCP1	YGR101W	1041 nt		10.68	□□□□□ -0.7
NSE3	Q05541	PHB2	YGR231C	933 nt		10.67	□□□□□ -0.7
NSE3	Q05541	MOB1	YIL106W	945 nt		10.66	□□□□□ -0.7
NSE3	Q05541	LEU2	YCL018W	1095 nt		10.66	□□□□□ -0.7
NSE3	Q05541	LSB6	YJL100W	1824 nt		10.65	□□□□□ -0.7
NSE3	Q05541	LYS20	YDL182W	1287 nt		10.65	□□□□□ -0.7
NSE3	Q05541	YJR154W	YJR154W	1041 nt		10.65	□□□□□ -0.7
NSE3	Q05541	QDR2	YIL121W	1629 nt		10.65	□□□□□ -0.7
NSE3	Q05541	YKR012C	YKR012C	378 nt		10.64	□□□□□ -0.71
NSE3	Q05541	MUP1	YGR055W	1725 nt		10.62	□□□□□ -0.71
NSE3	Q05541	ELO1	YJL196C	933 nt		10.62	□□□□□ -0.71
NSE3	Q05541	CYC3	YAL039C	810 nt		10.62	□□□□□ -0.71
NSE3	Q05541	KEL3	YPL263C	1956 nt		10.61	□□□□□ -0.71
NSE3	Q05541	NAM8	YHR086W	1572 nt		10.6	□□□□□ -0.71
NSE3	Q05541	SWM1	YDR260C	513 nt		10.59	□□□□□ -0.71
NSE3	Q05541	YDR510C-A	YDR510C-A	117 nt		10.58	□□□□□ -0.72
NSE3	Q05541	SER2	YGR208W	930 nt		10.58	□□□□□ -0.72
NSE3	Q05541	ARO8	YGL202W	1503 nt		10.57	□□□□□ -0.72
NSE3	Q05541	ITR2	YOL103W	1830 nt		10.56	□□□□□ -0.72
NSE3	Q05541	DLD3	YEL071W	1491 nt		10.55	□□□□□ -0.72
NSE3	Q05541	SWT21	YNL187W	1074 nt		10.55	□□□□□ -0.72
NSE3	Q05541	YMR007W	YMR007W	381 nt		10.54	□□□□□ -0.72
NSE3	Q05541	SDS24	YBR214W	1584 nt		10.53	□□□□□ -0.72
NSE3	Q05541	HTS1	YPR033C	1641 nt		10.53	□□□□□ -0.72
NSE3	Q05541	SFL1	YOR140W	2301 nt		10.52	□□□□□ -0.73
NSE3	Q05541	ENO1	YGR254W	1314 nt		10.52	□□□□□ -0.73
NSE3	Q05541	POP2	YNR052C	1302 nt		10.52	□□□□□ -0.73
NSE3	Q05541	CMP2	YML057W	1815 nt		10.51	□□□□□ -0.73
NSE3	Q05541	RCR1	YBR005W	642 nt		10.51	□□□□□ -0.73
NSE3	Q05541	snR31	snR31	225 nt		10.51	□□□□□ -0.73
NSE3	Q05541	KES1	YPL145C	1305 nt		10.51	□□□□□ -0.73
NSE3	Q05541	GID8	YMR135C	1368 nt		10.51	□□□□□ -0.73
NSE3	Q05541	MET1	YKR069W	1782 nt		10.5	□□□□□ -0.73
NSE3	Q05541	YER152W-A	YER152W-A	567 nt		10.49	□□□□□ -0.73
NSE3	Q05541	REX2	YLR059C	810 nt		10.49	□□□□□ -0.73
NSE3	Q05541	SUV3	YPL029W	2214 nt		10.49	□□□□□ -0.73
NSE3	Q05541	COQ8	YGL119W	1506 nt		10.48	□□□□□ -0.73
NSE3	Q05541	SRP102	YKL154W	735 nt		10.48	□□□□□ -0.73
NSE3	Q05541	HAP5	YOR358W	729 nt		10.48	□□□□□ -0.73
NSE3	Q05541	YMR265C	YMR265C	1386 nt		10.48	□□□□□ -0.73
NSE3	Q05541	RPN14	YGL004C	1254 nt		10.47	□□□□□ -0.73
NSE3	Q05541	YKL053W	YKL053W	375 nt		10.47	□□□□□ -0.73
NSE3	Q05541	YLR280C	YLR280C	351 nt		10.47	□□□□□ -0.73
NSE3	Q05541	VBA3	YCL069W	1377 nt		10.47	□□□□□ -0.73
NSE3	Q05541	TGA1	tA(UGC)A	73 nt		10.46	□□□□□ -0.73
NSE3	Q05541	tA(UGC)E	tA(UGC)E	73 nt		10.46	□□□□□ -0.73
NSE3	Q05541	tA(UGC)G	tA(UGC)G	73 nt		10.46	□□□□□ -0.73
NSE3	Q05541	tA(UGC)L	tA(UGC)L	73 nt		10.46	□□□□□ -0.73
NSE3	Q05541	tA(UGC)O	tA(UGC)O	73 nt		10.46	□□□□□ -0.73
NSE3	Q05541	VMA11	YPL234C	495 nt		10.46	□□□□□ -0.73
NSE3	Q05541	ERO1	YML130C	1692 nt		10.45	□□□□□ -0.74
NSE3	Q05541	SRP54	YPR088C	1626 nt		10.45	□□□□□ -0.74
NSE3	Q05541	YGR210C	YGR210C	1236 nt		10.45	□□□□□ -0.74

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