Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTK2Q05397 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTK2Q05397 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTK2Q05397 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTK2Q05397 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTK2Q05397 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTK2Q05397 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTK2Q05397 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTK2Q05397 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTK2Q05397 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTK2Q05397 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTK2Q05397 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTK2Q05397 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTK2Q05397 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTK2Q05397 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTK2Q05397 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTK2Q05397 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTK2Q05397 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTK2Q05397 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTK2Q05397 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTK2Q05397 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTK2Q05397 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTK2Q05397 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTK2Q05397 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTK2Q05397 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTK2Q05397 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTK2Q05397 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTK2Q05397 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTK2Q05397 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTK2Q05397 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTK2Q05397 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTK2Q05397 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTK2Q05397 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PTK2Q05397 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTK2Q05397 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTK2Q05397 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTK2Q05397 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTK2Q05397 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTK2Q05397 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PTK2Q05397 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTK2Q05397 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PTK2Q05397 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTK2Q05397 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTK2Q05397 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTK2Q05397 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTK2Q05397 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTK2Q05397 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTK2Q05397 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTK2Q05397 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTK2Q05397 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTK2Q05397 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTK2Q05397 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTK2Q05397 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTK2Q05397 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTK2Q05397 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PTK2Q05397 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTK2Q05397 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTK2Q05397 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTK2Q05397 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTK2Q05397 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTK2Q05397 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTK2Q05397 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTK2Q05397 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTK2Q05397 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTK2Q05397 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTK2Q05397 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTK2Q05397 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTK2Q05397 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTK2Q05397 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTK2Q05397 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTK2Q05397 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTK2Q05397 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTK2Q05397 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTK2Q05397 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTK2Q05397 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTK2Q05397 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTK2Q05397 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTK2Q05397 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTK2Q05397 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTK2Q05397 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTK2Q05397 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTK2Q05397 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PTK2Q05397 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTK2Q05397 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTK2Q05397 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTK2Q05397 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTK2Q05397 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTK2Q05397 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTK2Q05397 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTK2Q05397 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTK2Q05397 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PTK2Q05397 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTK2Q05397 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PTK2Q05397 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTK2Q05397 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTK2Q05397 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTK2Q05397 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PTK2Q05397 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTK2Q05397 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTK2Q05397 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms