Protein–RNA interactions for Protein: Q05048

CSTF1, Cleavage stimulation factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF1Q05048 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSTF1Q05048 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSTF1Q05048 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSTF1Q05048 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSTF1Q05048 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSTF1Q05048 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSTF1Q05048 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSTF1Q05048 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSTF1Q05048 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSTF1Q05048 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSTF1Q05048 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSTF1Q05048 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSTF1Q05048 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSTF1Q05048 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSTF1Q05048 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSTF1Q05048 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSTF1Q05048 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSTF1Q05048 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSTF1Q05048 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSTF1Q05048 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CSTF1Q05048 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSTF1Q05048 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSTF1Q05048 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSTF1Q05048 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSTF1Q05048 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSTF1Q05048 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSTF1Q05048 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSTF1Q05048 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSTF1Q05048 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSTF1Q05048 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSTF1Q05048 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSTF1Q05048 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSTF1Q05048 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSTF1Q05048 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSTF1Q05048 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSTF1Q05048 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSTF1Q05048 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSTF1Q05048 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSTF1Q05048 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSTF1Q05048 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSTF1Q05048 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CSTF1Q05048 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSTF1Q05048 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSTF1Q05048 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSTF1Q05048 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSTF1Q05048 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSTF1Q05048 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSTF1Q05048 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSTF1Q05048 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSTF1Q05048 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSTF1Q05048 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSTF1Q05048 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSTF1Q05048 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSTF1Q05048 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSTF1Q05048 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSTF1Q05048 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSTF1Q05048 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CSTF1Q05048 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CSTF1Q05048 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CSTF1Q05048 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSTF1Q05048 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSTF1Q05048 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CSTF1Q05048 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CSTF1Q05048 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CSTF1Q05048 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CSTF1Q05048 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CSTF1Q05048 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSTF1Q05048 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSTF1Q05048 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSTF1Q05048 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CSTF1Q05048 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CSTF1Q05048 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CSTF1Q05048 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CSTF1Q05048 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CSTF1Q05048 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSTF1Q05048 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSTF1Q05048 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CSTF1Q05048 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CSTF1Q05048 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CSTF1Q05048 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CSTF1Q05048 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSTF1Q05048 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSTF1Q05048 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSTF1Q05048 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSTF1Q05048 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSTF1Q05048 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CSTF1Q05048 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CSTF1Q05048 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSTF1Q05048 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CSTF1Q05048 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSTF1Q05048 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CSTF1Q05048 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSTF1Q05048 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSTF1Q05048 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSTF1Q05048 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSTF1Q05048 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSTF1Q05048 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSTF1Q05048 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSTF1Q05048 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSTF1Q05048 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.1 ms