Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CREMQ03060 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CREMQ03060 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CREMQ03060 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CREMQ03060 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CREMQ03060 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CREMQ03060 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CREMQ03060 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CREMQ03060 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CREMQ03060 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CREMQ03060 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CREMQ03060 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CREMQ03060 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CREMQ03060 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CREMQ03060 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CREMQ03060 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CREMQ03060 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CREMQ03060 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CREMQ03060 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CREMQ03060 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CREMQ03060 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CREMQ03060 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CREMQ03060 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CREMQ03060 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CREMQ03060 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CREMQ03060 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CREMQ03060 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CREMQ03060 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CREMQ03060 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CREMQ03060 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CREMQ03060 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CREMQ03060 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CREMQ03060 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CREMQ03060 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CREMQ03060 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CREMQ03060 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CREMQ03060 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CREMQ03060 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CREMQ03060 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CREMQ03060 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CREMQ03060 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CREMQ03060 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CREMQ03060 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CREMQ03060 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CREMQ03060 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CREMQ03060 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CREMQ03060 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CREMQ03060 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CREMQ03060 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CREMQ03060 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CREMQ03060 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CREMQ03060 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CREMQ03060 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CREMQ03060 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CREMQ03060 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CREMQ03060 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CREMQ03060 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CREMQ03060 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CREMQ03060 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CREMQ03060 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CREMQ03060 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CREMQ03060 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CREMQ03060 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CREMQ03060 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CREMQ03060 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CREMQ03060 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CREMQ03060 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CREMQ03060 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CREMQ03060 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CREMQ03060 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CREMQ03060 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CREMQ03060 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CREMQ03060 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CREMQ03060 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CREMQ03060 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CREMQ03060 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CREMQ03060 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CREMQ03060 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CREMQ03060 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CREMQ03060 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CREMQ03060 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CREMQ03060 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CREMQ03060 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CREMQ03060 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CREMQ03060 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CREMQ03060 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CREMQ03060 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CREMQ03060 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CREMQ03060 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CREMQ03060 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CREMQ03060 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CREMQ03060 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CREMQ03060 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CREMQ03060 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CREMQ03060 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CREMQ03060 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CREMQ03060 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CREMQ03060 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CREMQ03060 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CREMQ03060 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms