Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GCNT1Q02742 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GCNT1Q02742 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GCNT1Q02742 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GCNT1Q02742 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GCNT1Q02742 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GCNT1Q02742 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GCNT1Q02742 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GCNT1Q02742 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GCNT1Q02742 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GCNT1Q02742 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GCNT1Q02742 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GCNT1Q02742 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GCNT1Q02742 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GCNT1Q02742 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GCNT1Q02742 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GCNT1Q02742 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GCNT1Q02742 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GCNT1Q02742 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GCNT1Q02742 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GCNT1Q02742 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GCNT1Q02742 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GCNT1Q02742 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GCNT1Q02742 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GCNT1Q02742 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GCNT1Q02742 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GCNT1Q02742 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GCNT1Q02742 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GCNT1Q02742 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GCNT1Q02742 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GCNT1Q02742 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GCNT1Q02742 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GCNT1Q02742 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GCNT1Q02742 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GCNT1Q02742 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GCNT1Q02742 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GCNT1Q02742 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GCNT1Q02742 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GCNT1Q02742 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GCNT1Q02742 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GCNT1Q02742 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GCNT1Q02742 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GCNT1Q02742 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GCNT1Q02742 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GCNT1Q02742 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GCNT1Q02742 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GCNT1Q02742 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GCNT1Q02742 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GCNT1Q02742 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GCNT1Q02742 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GCNT1Q02742 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
GCNT1Q02742 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GCNT1Q02742 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GCNT1Q02742 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
GCNT1Q02742 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GCNT1Q02742 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GCNT1Q02742 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GCNT1Q02742 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GCNT1Q02742 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GCNT1Q02742 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GCNT1Q02742 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GCNT1Q02742 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GCNT1Q02742 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GCNT1Q02742 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GCNT1Q02742 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GCNT1Q02742 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GCNT1Q02742 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GCNT1Q02742 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GCNT1Q02742 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GCNT1Q02742 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GCNT1Q02742 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GCNT1Q02742 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GCNT1Q02742 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GCNT1Q02742 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GCNT1Q02742 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GCNT1Q02742 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GCNT1Q02742 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GCNT1Q02742 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GCNT1Q02742 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GCNT1Q02742 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GCNT1Q02742 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GCNT1Q02742 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GCNT1Q02742 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GCNT1Q02742 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GCNT1Q02742 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GCNT1Q02742 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GCNT1Q02742 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GCNT1Q02742 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GCNT1Q02742 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GCNT1Q02742 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GCNT1Q02742 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GCNT1Q02742 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
GCNT1Q02742 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GCNT1Q02742 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GCNT1Q02742 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GCNT1Q02742 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GCNT1Q02742 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
GCNT1Q02742 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GCNT1Q02742 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GCNT1Q02742 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms