Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OC90Q02509 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OC90Q02509 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OC90Q02509 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OC90Q02509 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OC90Q02509 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OC90Q02509 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
OC90Q02509 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OC90Q02509 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OC90Q02509 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OC90Q02509 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OC90Q02509 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OC90Q02509 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OC90Q02509 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OC90Q02509 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OC90Q02509 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OC90Q02509 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OC90Q02509 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OC90Q02509 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OC90Q02509 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OC90Q02509 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OC90Q02509 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OC90Q02509 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OC90Q02509 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OC90Q02509 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OC90Q02509 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OC90Q02509 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OC90Q02509 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OC90Q02509 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OC90Q02509 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OC90Q02509 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OC90Q02509 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OC90Q02509 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
OC90Q02509 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OC90Q02509 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OC90Q02509 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OC90Q02509 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OC90Q02509 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OC90Q02509 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OC90Q02509 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OC90Q02509 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OC90Q02509 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OC90Q02509 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OC90Q02509 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OC90Q02509 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OC90Q02509 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OC90Q02509 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OC90Q02509 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OC90Q02509 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OC90Q02509 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OC90Q02509 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OC90Q02509 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OC90Q02509 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
OC90Q02509 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OC90Q02509 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OC90Q02509 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OC90Q02509 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OC90Q02509 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OC90Q02509 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OC90Q02509 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OC90Q02509 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OC90Q02509 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OC90Q02509 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OC90Q02509 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OC90Q02509 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OC90Q02509 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OC90Q02509 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OC90Q02509 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OC90Q02509 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OC90Q02509 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
OC90Q02509 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
OC90Q02509 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OC90Q02509 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
OC90Q02509 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OC90Q02509 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OC90Q02509 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OC90Q02509 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
OC90Q02509 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OC90Q02509 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OC90Q02509 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OC90Q02509 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OC90Q02509 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OC90Q02509 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OC90Q02509 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
OC90Q02509 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
OC90Q02509 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
OC90Q02509 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OC90Q02509 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OC90Q02509 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OC90Q02509 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
OC90Q02509 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OC90Q02509 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OC90Q02509 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
OC90Q02509 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
OC90Q02509 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OC90Q02509 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OC90Q02509 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OC90Q02509 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OC90Q02509 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OC90Q02509 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms