Protein–RNA interactions for Protein: Q02447

SP3, Transcription factor Sp3, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP3Q02447 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SP3Q02447 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SP3Q02447 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SP3Q02447 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SP3Q02447 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SP3Q02447 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
SP3Q02447 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SP3Q02447 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SP3Q02447 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SP3Q02447 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SP3Q02447 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SP3Q02447 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SP3Q02447 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SP3Q02447 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SP3Q02447 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
SP3Q02447 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SP3Q02447 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SP3Q02447 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SP3Q02447 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SP3Q02447 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SP3Q02447 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SP3Q02447 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SP3Q02447 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SP3Q02447 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SP3Q02447 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SP3Q02447 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SP3Q02447 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SP3Q02447 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SP3Q02447 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SP3Q02447 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SP3Q02447 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SP3Q02447 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SP3Q02447 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SP3Q02447 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SP3Q02447 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SP3Q02447 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SP3Q02447 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SP3Q02447 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SP3Q02447 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SP3Q02447 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SP3Q02447 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SP3Q02447 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SP3Q02447 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SP3Q02447 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SP3Q02447 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SP3Q02447 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SP3Q02447 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SP3Q02447 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SP3Q02447 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SP3Q02447 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SP3Q02447 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SP3Q02447 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SP3Q02447 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SP3Q02447 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SP3Q02447 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SP3Q02447 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
SP3Q02447 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SP3Q02447 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SP3Q02447 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
SP3Q02447 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SP3Q02447 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SP3Q02447 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SP3Q02447 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SP3Q02447 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SP3Q02447 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SP3Q02447 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SP3Q02447 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SP3Q02447 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SP3Q02447 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SP3Q02447 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SP3Q02447 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SP3Q02447 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SP3Q02447 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SP3Q02447 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SP3Q02447 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SP3Q02447 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SP3Q02447 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
SP3Q02447 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SP3Q02447 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SP3Q02447 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SP3Q02447 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SP3Q02447 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SP3Q02447 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SP3Q02447 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SP3Q02447 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SP3Q02447 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SP3Q02447 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SP3Q02447 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SP3Q02447 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SP3Q02447 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SP3Q02447 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SP3Q02447 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SP3Q02447 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SP3Q02447 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SP3Q02447 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SP3Q02447 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SP3Q02447 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SP3Q02447 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SP3Q02447 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SP3Q02447 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms