Protein–RNA interactions for Protein: Q02338

BDH1, D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDH1Q02338 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BDH1Q02338 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BDH1Q02338 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BDH1Q02338 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BDH1Q02338 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BDH1Q02338 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BDH1Q02338 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BDH1Q02338 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BDH1Q02338 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BDH1Q02338 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BDH1Q02338 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BDH1Q02338 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BDH1Q02338 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BDH1Q02338 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BDH1Q02338 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BDH1Q02338 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BDH1Q02338 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BDH1Q02338 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BDH1Q02338 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BDH1Q02338 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BDH1Q02338 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BDH1Q02338 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BDH1Q02338 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BDH1Q02338 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BDH1Q02338 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BDH1Q02338 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BDH1Q02338 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BDH1Q02338 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BDH1Q02338 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BDH1Q02338 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BDH1Q02338 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BDH1Q02338 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BDH1Q02338 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BDH1Q02338 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BDH1Q02338 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BDH1Q02338 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BDH1Q02338 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BDH1Q02338 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BDH1Q02338 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BDH1Q02338 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BDH1Q02338 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BDH1Q02338 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BDH1Q02338 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BDH1Q02338 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BDH1Q02338 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BDH1Q02338 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BDH1Q02338 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BDH1Q02338 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BDH1Q02338 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BDH1Q02338 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BDH1Q02338 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BDH1Q02338 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BDH1Q02338 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BDH1Q02338 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BDH1Q02338 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BDH1Q02338 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BDH1Q02338 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BDH1Q02338 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BDH1Q02338 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BDH1Q02338 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BDH1Q02338 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BDH1Q02338 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BDH1Q02338 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BDH1Q02338 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BDH1Q02338 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BDH1Q02338 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BDH1Q02338 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BDH1Q02338 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BDH1Q02338 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BDH1Q02338 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BDH1Q02338 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BDH1Q02338 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BDH1Q02338 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BDH1Q02338 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BDH1Q02338 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BDH1Q02338 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BDH1Q02338 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BDH1Q02338 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BDH1Q02338 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BDH1Q02338 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BDH1Q02338 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BDH1Q02338 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BDH1Q02338 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BDH1Q02338 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BDH1Q02338 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BDH1Q02338 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BDH1Q02338 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BDH1Q02338 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BDH1Q02338 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BDH1Q02338 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BDH1Q02338 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BDH1Q02338 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BDH1Q02338 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BDH1Q02338 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BDH1Q02338 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BDH1Q02338 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BDH1Q02338 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BDH1Q02338 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BDH1Q02338 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BDH1Q02338 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms