Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SATB1Q01826 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SATB1Q01826 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SATB1Q01826 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SATB1Q01826 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SATB1Q01826 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SATB1Q01826 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SATB1Q01826 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SATB1Q01826 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SATB1Q01826 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SATB1Q01826 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SATB1Q01826 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SATB1Q01826 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SATB1Q01826 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SATB1Q01826 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SATB1Q01826 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SATB1Q01826 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SATB1Q01826 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SATB1Q01826 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SATB1Q01826 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SATB1Q01826 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SATB1Q01826 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SATB1Q01826 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SATB1Q01826 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SATB1Q01826 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SATB1Q01826 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SATB1Q01826 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SATB1Q01826 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SATB1Q01826 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SATB1Q01826 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SATB1Q01826 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SATB1Q01826 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SATB1Q01826 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SATB1Q01826 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SATB1Q01826 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SATB1Q01826 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SATB1Q01826 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SATB1Q01826 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SATB1Q01826 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SATB1Q01826 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SATB1Q01826 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SATB1Q01826 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SATB1Q01826 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SATB1Q01826 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SATB1Q01826 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SATB1Q01826 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SATB1Q01826 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SATB1Q01826 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SATB1Q01826 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SATB1Q01826 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SATB1Q01826 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SATB1Q01826 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SATB1Q01826 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SATB1Q01826 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SATB1Q01826 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SATB1Q01826 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SATB1Q01826 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SATB1Q01826 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SATB1Q01826 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SATB1Q01826 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SATB1Q01826 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SATB1Q01826 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SATB1Q01826 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SATB1Q01826 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SATB1Q01826 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SATB1Q01826 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SATB1Q01826 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SATB1Q01826 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SATB1Q01826 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SATB1Q01826 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SATB1Q01826 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SATB1Q01826 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SATB1Q01826 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SATB1Q01826 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SATB1Q01826 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SATB1Q01826 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SATB1Q01826 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SATB1Q01826 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SATB1Q01826 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SATB1Q01826 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SATB1Q01826 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SATB1Q01826 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SATB1Q01826 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SATB1Q01826 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SATB1Q01826 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SATB1Q01826 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SATB1Q01826 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SATB1Q01826 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SATB1Q01826 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SATB1Q01826 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SATB1Q01826 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SATB1Q01826 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SATB1Q01826 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SATB1Q01826 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SATB1Q01826 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SATB1Q01826 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SATB1Q01826 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SATB1Q01826 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SATB1Q01826 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SATB1Q01826 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms