Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MC1RQ01726 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MC1RQ01726 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MC1RQ01726 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MC1RQ01726 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MC1RQ01726 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MC1RQ01726 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MC1RQ01726 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MC1RQ01726 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MC1RQ01726 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MC1RQ01726 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MC1RQ01726 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MC1RQ01726 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MC1RQ01726 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MC1RQ01726 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MC1RQ01726 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MC1RQ01726 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MC1RQ01726 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MC1RQ01726 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MC1RQ01726 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MC1RQ01726 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MC1RQ01726 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MC1RQ01726 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MC1RQ01726 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MC1RQ01726 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MC1RQ01726 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MC1RQ01726 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MC1RQ01726 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MC1RQ01726 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MC1RQ01726 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MC1RQ01726 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MC1RQ01726 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MC1RQ01726 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MC1RQ01726 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MC1RQ01726 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MC1RQ01726 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MC1RQ01726 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MC1RQ01726 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MC1RQ01726 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MC1RQ01726 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MC1RQ01726 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MC1RQ01726 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MC1RQ01726 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MC1RQ01726 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MC1RQ01726 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MC1RQ01726 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MC1RQ01726 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MC1RQ01726 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MC1RQ01726 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MC1RQ01726 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MC1RQ01726 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MC1RQ01726 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MC1RQ01726 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MC1RQ01726 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MC1RQ01726 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MC1RQ01726 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MC1RQ01726 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MC1RQ01726 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MC1RQ01726 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MC1RQ01726 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MC1RQ01726 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MC1RQ01726 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MC1RQ01726 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MC1RQ01726 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MC1RQ01726 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MC1RQ01726 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MC1RQ01726 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MC1RQ01726 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MC1RQ01726 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MC1RQ01726 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MC1RQ01726 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MC1RQ01726 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MC1RQ01726 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MC1RQ01726 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MC1RQ01726 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MC1RQ01726 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MC1RQ01726 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MC1RQ01726 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MC1RQ01726 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MC1RQ01726 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MC1RQ01726 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MC1RQ01726 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MC1RQ01726 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MC1RQ01726 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MC1RQ01726 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MC1RQ01726 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MC1RQ01726 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MC1RQ01726 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MC1RQ01726 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MC1RQ01726 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MC1RQ01726 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MC1RQ01726 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MC1RQ01726 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MC1RQ01726 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MC1RQ01726 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MC1RQ01726 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MC1RQ01726 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MC1RQ01726 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MC1RQ01726 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MC1RQ01726 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms