Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
E2F1Q01094 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
E2F1Q01094 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
E2F1Q01094 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
E2F1Q01094 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
E2F1Q01094 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
E2F1Q01094 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
E2F1Q01094 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
E2F1Q01094 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
E2F1Q01094 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
E2F1Q01094 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
E2F1Q01094 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
E2F1Q01094 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
E2F1Q01094 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
E2F1Q01094 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
E2F1Q01094 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
E2F1Q01094 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
E2F1Q01094 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
E2F1Q01094 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
E2F1Q01094 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
E2F1Q01094 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
E2F1Q01094 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
E2F1Q01094 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
E2F1Q01094 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
E2F1Q01094 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
E2F1Q01094 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
E2F1Q01094 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
E2F1Q01094 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
E2F1Q01094 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
E2F1Q01094 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
E2F1Q01094 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
E2F1Q01094 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
E2F1Q01094 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
E2F1Q01094 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
E2F1Q01094 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
E2F1Q01094 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
E2F1Q01094 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
E2F1Q01094 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
E2F1Q01094 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
E2F1Q01094 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
E2F1Q01094 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
E2F1Q01094 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
E2F1Q01094 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
E2F1Q01094 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
E2F1Q01094 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
E2F1Q01094 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
E2F1Q01094 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
E2F1Q01094 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
E2F1Q01094 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
E2F1Q01094 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
E2F1Q01094 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
E2F1Q01094 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
E2F1Q01094 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
E2F1Q01094 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
E2F1Q01094 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
E2F1Q01094 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
E2F1Q01094 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
E2F1Q01094 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
E2F1Q01094 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
E2F1Q01094 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
E2F1Q01094 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
E2F1Q01094 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
E2F1Q01094 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
E2F1Q01094 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
E2F1Q01094 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
E2F1Q01094 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
E2F1Q01094 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
E2F1Q01094 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
E2F1Q01094 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E2F1Q01094 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E2F1Q01094 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E2F1Q01094 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E2F1Q01094 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E2F1Q01094 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E2F1Q01094 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E2F1Q01094 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E2F1Q01094 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E2F1Q01094 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E2F1Q01094 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
E2F1Q01094 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
E2F1Q01094 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
E2F1Q01094 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
E2F1Q01094 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
E2F1Q01094 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
E2F1Q01094 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
E2F1Q01094 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
E2F1Q01094 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
E2F1Q01094 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
E2F1Q01094 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
E2F1Q01094 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
E2F1Q01094 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
E2F1Q01094 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
E2F1Q01094 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
E2F1Q01094 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
E2F1Q01094 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
E2F1Q01094 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
E2F1Q01094 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
E2F1Q01094 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
E2F1Q01094 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
E2F1Q01094 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms