Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFKB2Q00653 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFKB2Q00653 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NFKB2Q00653 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFKB2Q00653 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFKB2Q00653 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFKB2Q00653 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFKB2Q00653 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFKB2Q00653 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NFKB2Q00653 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NFKB2Q00653 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NFKB2Q00653 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFKB2Q00653 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NFKB2Q00653 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFKB2Q00653 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFKB2Q00653 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFKB2Q00653 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFKB2Q00653 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFKB2Q00653 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFKB2Q00653 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFKB2Q00653 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFKB2Q00653 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFKB2Q00653 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFKB2Q00653 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NFKB2Q00653 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFKB2Q00653 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFKB2Q00653 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFKB2Q00653 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFKB2Q00653 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFKB2Q00653 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFKB2Q00653 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFKB2Q00653 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFKB2Q00653 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFKB2Q00653 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFKB2Q00653 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFKB2Q00653 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NFKB2Q00653 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFKB2Q00653 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFKB2Q00653 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFKB2Q00653 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NFKB2Q00653 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFKB2Q00653 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFKB2Q00653 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFKB2Q00653 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFKB2Q00653 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFKB2Q00653 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFKB2Q00653 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFKB2Q00653 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFKB2Q00653 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFKB2Q00653 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NFKB2Q00653 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFKB2Q00653 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFKB2Q00653 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFKB2Q00653 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NFKB2Q00653 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NFKB2Q00653 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFKB2Q00653 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFKB2Q00653 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFKB2Q00653 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFKB2Q00653 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFKB2Q00653 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFKB2Q00653 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFKB2Q00653 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFKB2Q00653 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NFKB2Q00653 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFKB2Q00653 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFKB2Q00653 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFKB2Q00653 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFKB2Q00653 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFKB2Q00653 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFKB2Q00653 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFKB2Q00653 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFKB2Q00653 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFKB2Q00653 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NFKB2Q00653 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFKB2Q00653 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NFKB2Q00653 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFKB2Q00653 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFKB2Q00653 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFKB2Q00653 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFKB2Q00653 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFKB2Q00653 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFKB2Q00653 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFKB2Q00653 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFKB2Q00653 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFKB2Q00653 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFKB2Q00653 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NFKB2Q00653 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFKB2Q00653 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFKB2Q00653 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFKB2Q00653 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFKB2Q00653 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NFKB2Q00653 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NFKB2Q00653 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFKB2Q00653 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFKB2Q00653 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFKB2Q00653 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFKB2Q00653 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFKB2Q00653 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFKB2Q00653 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms