Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COG7P83436 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
COG7P83436 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COG7P83436 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COG7P83436 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
COG7P83436 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COG7P83436 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COG7P83436 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COG7P83436 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COG7P83436 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
COG7P83436 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COG7P83436 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COG7P83436 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COG7P83436 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COG7P83436 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COG7P83436 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COG7P83436 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COG7P83436 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COG7P83436 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COG7P83436 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
COG7P83436 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COG7P83436 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COG7P83436 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COG7P83436 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COG7P83436 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COG7P83436 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COG7P83436 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COG7P83436 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COG7P83436 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COG7P83436 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COG7P83436 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COG7P83436 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COG7P83436 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COG7P83436 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COG7P83436 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COG7P83436 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COG7P83436 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COG7P83436 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COG7P83436 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COG7P83436 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
COG7P83436 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COG7P83436 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
COG7P83436 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COG7P83436 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COG7P83436 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COG7P83436 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COG7P83436 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COG7P83436 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
COG7P83436 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COG7P83436 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COG7P83436 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COG7P83436 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COG7P83436 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
COG7P83436 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
COG7P83436 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COG7P83436 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COG7P83436 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COG7P83436 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COG7P83436 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COG7P83436 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
COG7P83436 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
COG7P83436 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COG7P83436 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COG7P83436 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COG7P83436 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COG7P83436 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COG7P83436 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COG7P83436 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COG7P83436 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COG7P83436 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COG7P83436 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COG7P83436 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COG7P83436 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
COG7P83436 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
COG7P83436 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
COG7P83436 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COG7P83436 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COG7P83436 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COG7P83436 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COG7P83436 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COG7P83436 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COG7P83436 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
COG7P83436 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COG7P83436 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COG7P83436 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COG7P83436 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COG7P83436 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COG7P83436 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COG7P83436 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COG7P83436 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COG7P83436 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COG7P83436 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COG7P83436 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
COG7P83436 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COG7P83436 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COG7P83436 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COG7P83436 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COG7P83436 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COG7P83436 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COG7P83436 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms