Protein–RNA interactions for Protein: P69891

HBG1, Hemoglobin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBG1P69891 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HBG1P69891 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HBG1P69891 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HBG1P69891 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HBG1P69891 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HBG1P69891 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HBG1P69891 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HBG1P69891 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HBG1P69891 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HBG1P69891 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HBG1P69891 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HBG1P69891 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HBG1P69891 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HBG1P69891 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HBG1P69891 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HBG1P69891 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HBG1P69891 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HBG1P69891 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HBG1P69891 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HBG1P69891 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HBG1P69891 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HBG1P69891 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HBG1P69891 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HBG1P69891 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HBG1P69891 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HBG1P69891 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HBG1P69891 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HBG1P69891 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HBG1P69891 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HBG1P69891 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HBG1P69891 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HBG1P69891 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HBG1P69891 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HBG1P69891 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HBG1P69891 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HBG1P69891 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HBG1P69891 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HBG1P69891 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HBG1P69891 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HBG1P69891 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HBG1P69891 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HBG1P69891 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HBG1P69891 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HBG1P69891 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HBG1P69891 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HBG1P69891 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HBG1P69891 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HBG1P69891 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HBG1P69891 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HBG1P69891 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HBG1P69891 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HBG1P69891 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HBG1P69891 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HBG1P69891 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HBG1P69891 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HBG1P69891 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HBG1P69891 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HBG1P69891 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HBG1P69891 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HBG1P69891 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HBG1P69891 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HBG1P69891 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HBG1P69891 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HBG1P69891 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HBG1P69891 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HBG1P69891 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HBG1P69891 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HBG1P69891 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HBG1P69891 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HBG1P69891 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HBG1P69891 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HBG1P69891 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HBG1P69891 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HBG1P69891 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HBG1P69891 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HBG1P69891 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HBG1P69891 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HBG1P69891 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HBG1P69891 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HBG1P69891 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HBG1P69891 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HBG1P69891 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HBG1P69891 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HBG1P69891 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HBG1P69891 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HBG1P69891 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HBG1P69891 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HBG1P69891 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HBG1P69891 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HBG1P69891 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HBG1P69891 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HBG1P69891 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HBG1P69891 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HBG1P69891 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HBG1P69891 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HBG1P69891 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HBG1P69891 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HBG1P69891 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HBG1P69891 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HBG1P69891 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms