Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTG1P63261 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTG1P63261 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTG1P63261 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTG1P63261 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTG1P63261 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTG1P63261 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTG1P63261 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTG1P63261 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTG1P63261 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTG1P63261 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTG1P63261 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTG1P63261 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTG1P63261 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTG1P63261 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTG1P63261 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTG1P63261 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTG1P63261 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTG1P63261 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTG1P63261 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTG1P63261 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTG1P63261 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTG1P63261 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTG1P63261 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTG1P63261 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTG1P63261 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTG1P63261 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTG1P63261 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTG1P63261 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTG1P63261 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTG1P63261 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTG1P63261 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTG1P63261 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTG1P63261 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTG1P63261 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTG1P63261 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTG1P63261 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTG1P63261 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTG1P63261 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTG1P63261 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTG1P63261 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACTG1P63261 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACTG1P63261 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTG1P63261 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTG1P63261 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTG1P63261 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTG1P63261 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTG1P63261 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTG1P63261 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTG1P63261 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTG1P63261 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTG1P63261 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTG1P63261 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTG1P63261 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTG1P63261 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTG1P63261 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTG1P63261 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTG1P63261 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTG1P63261 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTG1P63261 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTG1P63261 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTG1P63261 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTG1P63261 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTG1P63261 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTG1P63261 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTG1P63261 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTG1P63261 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTG1P63261 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTG1P63261 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTG1P63261 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTG1P63261 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTG1P63261 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTG1P63261 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTG1P63261 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTG1P63261 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTG1P63261 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTG1P63261 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTG1P63261 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTG1P63261 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTG1P63261 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTG1P63261 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTG1P63261 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTG1P63261 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTG1P63261 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTG1P63261 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTG1P63261 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTG1P63261 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTG1P63261 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTG1P63261 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTG1P63261 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTG1P63261 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTG1P63261 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTG1P63261 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTG1P63261 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTG1P63261 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTG1P63261 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTG1P63261 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTG1P63261 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTG1P63261 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTG1P63261 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms