Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHMP4BP1P59074 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHMP4BP1P59074 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHMP4BP1P59074 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHMP4BP1P59074 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHMP4BP1P59074 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHMP4BP1P59074 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHMP4BP1P59074 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHMP4BP1P59074 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHMP4BP1P59074 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHMP4BP1P59074 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHMP4BP1P59074 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHMP4BP1P59074 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHMP4BP1P59074 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHMP4BP1P59074 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHMP4BP1P59074 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHMP4BP1P59074 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHMP4BP1P59074 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHMP4BP1P59074 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHMP4BP1P59074 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHMP4BP1P59074 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHMP4BP1P59074 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHMP4BP1P59074 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHMP4BP1P59074 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CHMP4BP1P59074 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHMP4BP1P59074 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHMP4BP1P59074 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHMP4BP1P59074 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHMP4BP1P59074 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHMP4BP1P59074 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHMP4BP1P59074 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHMP4BP1P59074 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHMP4BP1P59074 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHMP4BP1P59074 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHMP4BP1P59074 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CHMP4BP1P59074 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHMP4BP1P59074 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHMP4BP1P59074 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHMP4BP1P59074 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHMP4BP1P59074 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHMP4BP1P59074 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHMP4BP1P59074 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHMP4BP1P59074 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHMP4BP1P59074 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CHMP4BP1P59074 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHMP4BP1P59074 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHMP4BP1P59074 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CHMP4BP1P59074 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CHMP4BP1P59074 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CHMP4BP1P59074 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CHMP4BP1P59074 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CHMP4BP1P59074 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CHMP4BP1P59074 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHMP4BP1P59074 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHMP4BP1P59074 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHMP4BP1P59074 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHMP4BP1P59074 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHMP4BP1P59074 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHMP4BP1P59074 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHMP4BP1P59074 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHMP4BP1P59074 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CHMP4BP1P59074 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHMP4BP1P59074 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHMP4BP1P59074 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHMP4BP1P59074 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHMP4BP1P59074 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHMP4BP1P59074 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CHMP4BP1P59074 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHMP4BP1P59074 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHMP4BP1P59074 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHMP4BP1P59074 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHMP4BP1P59074 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHMP4BP1P59074 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CHMP4BP1P59074 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CHMP4BP1P59074 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHMP4BP1P59074 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHMP4BP1P59074 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHMP4BP1P59074 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHMP4BP1P59074 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHMP4BP1P59074 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHMP4BP1P59074 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHMP4BP1P59074 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHMP4BP1P59074 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHMP4BP1P59074 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHMP4BP1P59074 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHMP4BP1P59074 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CHMP4BP1P59074 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHMP4BP1P59074 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHMP4BP1P59074 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHMP4BP1P59074 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CHMP4BP1P59074 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHMP4BP1P59074 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHMP4BP1P59074 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHMP4BP1P59074 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHMP4BP1P59074 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHMP4BP1P59074 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHMP4BP1P59074 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHMP4BP1P59074 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHMP4BP1P59074 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHMP4BP1P59074 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms