Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXW4P57775 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXW4P57775 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXW4P57775 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXW4P57775 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXW4P57775 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXW4P57775 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXW4P57775 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXW4P57775 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXW4P57775 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXW4P57775 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXW4P57775 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXW4P57775 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXW4P57775 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXW4P57775 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXW4P57775 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXW4P57775 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXW4P57775 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXW4P57775 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXW4P57775 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXW4P57775 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXW4P57775 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXW4P57775 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXW4P57775 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXW4P57775 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXW4P57775 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXW4P57775 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FBXW4P57775 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXW4P57775 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXW4P57775 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FBXW4P57775 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXW4P57775 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FBXW4P57775 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXW4P57775 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXW4P57775 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXW4P57775 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXW4P57775 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FBXW4P57775 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXW4P57775 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXW4P57775 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXW4P57775 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXW4P57775 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXW4P57775 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXW4P57775 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXW4P57775 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXW4P57775 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXW4P57775 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXW4P57775 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXW4P57775 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXW4P57775 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXW4P57775 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FBXW4P57775 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXW4P57775 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXW4P57775 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXW4P57775 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXW4P57775 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXW4P57775 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXW4P57775 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXW4P57775 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXW4P57775 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXW4P57775 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXW4P57775 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXW4P57775 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXW4P57775 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXW4P57775 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXW4P57775 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXW4P57775 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXW4P57775 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXW4P57775 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXW4P57775 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXW4P57775 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXW4P57775 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXW4P57775 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXW4P57775 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXW4P57775 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXW4P57775 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXW4P57775 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXW4P57775 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXW4P57775 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXW4P57775 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXW4P57775 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXW4P57775 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXW4P57775 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXW4P57775 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXW4P57775 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXW4P57775 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXW4P57775 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXW4P57775 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXW4P57775 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXW4P57775 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXW4P57775 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXW4P57775 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXW4P57775 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXW4P57775 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXW4P57775 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXW4P57775 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXW4P57775 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXW4P57775 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXW4P57775 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXW4P57775 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.9 ms