Protein–RNA interactions for Protein: P57086

SCAND1, SCAN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAND1P57086 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCAND1P57086 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAND1P57086 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCAND1P57086 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAND1P57086 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAND1P57086 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCAND1P57086 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAND1P57086 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAND1P57086 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAND1P57086 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAND1P57086 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAND1P57086 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCAND1P57086 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAND1P57086 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAND1P57086 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCAND1P57086 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAND1P57086 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAND1P57086 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAND1P57086 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAND1P57086 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAND1P57086 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAND1P57086 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAND1P57086 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAND1P57086 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAND1P57086 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAND1P57086 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAND1P57086 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAND1P57086 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAND1P57086 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAND1P57086 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAND1P57086 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAND1P57086 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAND1P57086 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAND1P57086 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAND1P57086 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAND1P57086 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAND1P57086 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAND1P57086 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAND1P57086 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SCAND1P57086 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAND1P57086 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAND1P57086 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAND1P57086 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAND1P57086 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAND1P57086 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAND1P57086 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAND1P57086 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAND1P57086 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAND1P57086 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAND1P57086 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAND1P57086 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAND1P57086 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAND1P57086 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAND1P57086 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAND1P57086 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAND1P57086 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAND1P57086 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAND1P57086 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAND1P57086 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAND1P57086 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAND1P57086 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAND1P57086 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAND1P57086 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAND1P57086 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAND1P57086 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAND1P57086 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAND1P57086 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAND1P57086 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAND1P57086 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAND1P57086 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAND1P57086 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAND1P57086 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAND1P57086 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAND1P57086 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAND1P57086 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAND1P57086 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAND1P57086 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAND1P57086 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAND1P57086 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAND1P57086 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAND1P57086 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAND1P57086 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCAND1P57086 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAND1P57086 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAND1P57086 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAND1P57086 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAND1P57086 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCAND1P57086 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAND1P57086 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAND1P57086 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAND1P57086 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAND1P57086 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCAND1P57086 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAND1P57086 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCAND1P57086 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCAND1P57086 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCAND1P57086 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAND1P57086 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAND1P57086 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCAND1P57086 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.5 ms