Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2BFSP57053 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2BFSP57053 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2BFSP57053 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
H2BFSP57053 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2BFSP57053 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2BFSP57053 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2BFSP57053 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2BFSP57053 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2BFSP57053 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2BFSP57053 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2BFSP57053 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2BFSP57053 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2BFSP57053 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2BFSP57053 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2BFSP57053 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2BFSP57053 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2BFSP57053 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2BFSP57053 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2BFSP57053 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2BFSP57053 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2BFSP57053 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2BFSP57053 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2BFSP57053 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2BFSP57053 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2BFSP57053 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2BFSP57053 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2BFSP57053 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2BFSP57053 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2BFSP57053 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2BFSP57053 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2BFSP57053 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2BFSP57053 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2BFSP57053 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2BFSP57053 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2BFSP57053 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2BFSP57053 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2BFSP57053 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2BFSP57053 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2BFSP57053 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2BFSP57053 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2BFSP57053 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2BFSP57053 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2BFSP57053 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2BFSP57053 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2BFSP57053 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2BFSP57053 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2BFSP57053 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
H2BFSP57053 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
H2BFSP57053 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2BFSP57053 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2BFSP57053 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2BFSP57053 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2BFSP57053 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2BFSP57053 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2BFSP57053 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2BFSP57053 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2BFSP57053 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2BFSP57053 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2BFSP57053 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2BFSP57053 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2BFSP57053 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2BFSP57053 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2BFSP57053 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
H2BFSP57053 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2BFSP57053 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2BFSP57053 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2BFSP57053 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
H2BFSP57053 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2BFSP57053 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2BFSP57053 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2BFSP57053 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2BFSP57053 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2BFSP57053 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2BFSP57053 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2BFSP57053 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2BFSP57053 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2BFSP57053 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2BFSP57053 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2BFSP57053 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2BFSP57053 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2BFSP57053 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2BFSP57053 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2BFSP57053 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2BFSP57053 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2BFSP57053 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2BFSP57053 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
H2BFSP57053 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
H2BFSP57053 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
H2BFSP57053 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2BFSP57053 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2BFSP57053 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2BFSP57053 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2BFSP57053 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2BFSP57053 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2BFSP57053 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2BFSP57053 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2BFSP57053 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2BFSP57053 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2BFSP57053 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms