Protein–RNA interactions for Protein: P56696

KCNQ4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ4P56696 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
KCNQ4P56696 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
KCNQ4P56696 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
KCNQ4P56696 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
KCNQ4P56696 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
KCNQ4P56696 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
KCNQ4P56696 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
KCNQ4P56696 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
KCNQ4P56696 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
KCNQ4P56696 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
KCNQ4P56696 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
KCNQ4P56696 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
KCNQ4P56696 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
KCNQ4P56696 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
KCNQ4P56696 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
KCNQ4P56696 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
KCNQ4P56696 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
KCNQ4P56696 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
KCNQ4P56696 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
KCNQ4P56696 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
KCNQ4P56696 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
KCNQ4P56696 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
KCNQ4P56696 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
KCNQ4P56696 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
KCNQ4P56696 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
KCNQ4P56696 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KCNQ4P56696 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
KCNQ4P56696 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
KCNQ4P56696 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
KCNQ4P56696 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
KCNQ4P56696 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
KCNQ4P56696 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
KCNQ4P56696 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
KCNQ4P56696 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
KCNQ4P56696 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
KCNQ4P56696 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
KCNQ4P56696 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
KCNQ4P56696 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
KCNQ4P56696 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
KCNQ4P56696 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
KCNQ4P56696 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
KCNQ4P56696 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
KCNQ4P56696 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KCNQ4P56696 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
KCNQ4P56696 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
KCNQ4P56696 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
KCNQ4P56696 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
KCNQ4P56696 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
KCNQ4P56696 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
KCNQ4P56696 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
KCNQ4P56696 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
KCNQ4P56696 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
KCNQ4P56696 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
KCNQ4P56696 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
KCNQ4P56696 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
KCNQ4P56696 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
KCNQ4P56696 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KCNQ4P56696 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
KCNQ4P56696 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
KCNQ4P56696 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
KCNQ4P56696 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
KCNQ4P56696 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
KCNQ4P56696 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
KCNQ4P56696 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
KCNQ4P56696 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
KCNQ4P56696 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
KCNQ4P56696 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KCNQ4P56696 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
KCNQ4P56696 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
KCNQ4P56696 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
KCNQ4P56696 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
KCNQ4P56696 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
KCNQ4P56696 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
KCNQ4P56696 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
KCNQ4P56696 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
KCNQ4P56696 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
KCNQ4P56696 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
KCNQ4P56696 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
KCNQ4P56696 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
KCNQ4P56696 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
KCNQ4P56696 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
KCNQ4P56696 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
KCNQ4P56696 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KCNQ4P56696 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KCNQ4P56696 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
KCNQ4P56696 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KCNQ4P56696 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KCNQ4P56696 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KCNQ4P56696 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
KCNQ4P56696 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
KCNQ4P56696 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
KCNQ4P56696 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
KCNQ4P56696 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
KCNQ4P56696 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
KCNQ4P56696 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
KCNQ4P56696 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
KCNQ4P56696 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KCNQ4P56696 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KCNQ4P56696 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KCNQ4P56696 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms