Protein–RNA interactions for Protein: P56645

PER3, Period circadian protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PER3P56645 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PER3P56645 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PER3P56645 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PER3P56645 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PER3P56645 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PER3P56645 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PER3P56645 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PER3P56645 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PER3P56645 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PER3P56645 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PER3P56645 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PER3P56645 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PER3P56645 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PER3P56645 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PER3P56645 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PER3P56645 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PER3P56645 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PER3P56645 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PER3P56645 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PER3P56645 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PER3P56645 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PER3P56645 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PER3P56645 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PER3P56645 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PER3P56645 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PER3P56645 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PER3P56645 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PER3P56645 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PER3P56645 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PER3P56645 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PER3P56645 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PER3P56645 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PER3P56645 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PER3P56645 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PER3P56645 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PER3P56645 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PER3P56645 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PER3P56645 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PER3P56645 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PER3P56645 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PER3P56645 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PER3P56645 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PER3P56645 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PER3P56645 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PER3P56645 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PER3P56645 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PER3P56645 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PER3P56645 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PER3P56645 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PER3P56645 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PER3P56645 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PER3P56645 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PER3P56645 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PER3P56645 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PER3P56645 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PER3P56645 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PER3P56645 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PER3P56645 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PER3P56645 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PER3P56645 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PER3P56645 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PER3P56645 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PER3P56645 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PER3P56645 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PER3P56645 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PER3P56645 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PER3P56645 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PER3P56645 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PER3P56645 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PER3P56645 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PER3P56645 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PER3P56645 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PER3P56645 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PER3P56645 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PER3P56645 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PER3P56645 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PER3P56645 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PER3P56645 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PER3P56645 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PER3P56645 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PER3P56645 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PER3P56645 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PER3P56645 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PER3P56645 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PER3P56645 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PER3P56645 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PER3P56645 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PER3P56645 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PER3P56645 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PER3P56645 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PER3P56645 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PER3P56645 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PER3P56645 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PER3P56645 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PER3P56645 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PER3P56645 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PER3P56645 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PER3P56645 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PER3P56645 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PER3P56645 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms