Protein–RNA interactions for Protein: P56199

ITGA1, Integrin alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA1P56199 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA1P56199 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA1P56199 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA1P56199 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA1P56199 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA1P56199 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA1P56199 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGA1P56199 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGA1P56199 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGA1P56199 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGA1P56199 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGA1P56199 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGA1P56199 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGA1P56199 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA1P56199 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA1P56199 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA1P56199 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA1P56199 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA1P56199 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA1P56199 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA1P56199 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA1P56199 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA1P56199 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA1P56199 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA1P56199 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA1P56199 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA1P56199 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA1P56199 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA1P56199 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA1P56199 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA1P56199 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ITGA1P56199 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ITGA1P56199 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGA1P56199 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA1P56199 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA1P56199 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA1P56199 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA1P56199 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA1P56199 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA1P56199 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA1P56199 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA1P56199 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA1P56199 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA1P56199 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA1P56199 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA1P56199 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA1P56199 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA1P56199 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA1P56199 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA1P56199 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA1P56199 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA1P56199 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA1P56199 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA1P56199 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA1P56199 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA1P56199 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA1P56199 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA1P56199 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA1P56199 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA1P56199 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA1P56199 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA1P56199 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA1P56199 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA1P56199 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA1P56199 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA1P56199 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA1P56199 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA1P56199 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA1P56199 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA1P56199 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA1P56199 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA1P56199 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA1P56199 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA1P56199 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA1P56199 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA1P56199 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA1P56199 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA1P56199 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA1P56199 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA1P56199 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ITGA1P56199 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ITGA1P56199 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA1P56199 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA1P56199 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA1P56199 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA1P56199 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA1P56199 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA1P56199 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA1P56199 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA1P56199 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA1P56199 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA1P56199 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA1P56199 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA1P56199 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA1P56199 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA1P56199 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA1P56199 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA1P56199 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA1P56199 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA1P56199 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms