Protein–RNA interactions for Protein: P55157

MTTP, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTPP55157 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTTPP55157 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTTPP55157 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTTPP55157 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTTPP55157 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTTPP55157 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTTPP55157 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTTPP55157 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MTTPP55157 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTTPP55157 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTTPP55157 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTTPP55157 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTTPP55157 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTTPP55157 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MTTPP55157 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MTTPP55157 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MTTPP55157 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MTTPP55157 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MTTPP55157 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTTPP55157 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTTPP55157 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTTPP55157 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTTPP55157 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTTPP55157 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTTPP55157 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTTPP55157 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTTPP55157 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTTPP55157 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTTPP55157 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTTPP55157 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTTPP55157 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTTPP55157 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTTPP55157 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTTPP55157 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTTPP55157 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTTPP55157 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTTPP55157 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTTPP55157 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTTPP55157 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTTPP55157 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTTPP55157 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTTPP55157 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTTPP55157 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTTPP55157 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTTPP55157 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTTPP55157 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTTPP55157 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTTPP55157 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MTTPP55157 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MTTPP55157 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTTPP55157 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTTPP55157 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTTPP55157 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTTPP55157 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTTPP55157 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MTTPP55157 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTTPP55157 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTTPP55157 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTTPP55157 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTTPP55157 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTTPP55157 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTTPP55157 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTTPP55157 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTTPP55157 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTTPP55157 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTTPP55157 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTTPP55157 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MTTPP55157 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MTTPP55157 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTTPP55157 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTTPP55157 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTTPP55157 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTTPP55157 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTTPP55157 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTTPP55157 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTTPP55157 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTTPP55157 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTTPP55157 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTTPP55157 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTTPP55157 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTTPP55157 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTTPP55157 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTTPP55157 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTTPP55157 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTTPP55157 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTTPP55157 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTTPP55157 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTTPP55157 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTTPP55157 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MTTPP55157 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTTPP55157 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTTPP55157 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTTPP55157 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTTPP55157 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTTPP55157 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTTPP55157 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTTPP55157 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTTPP55157 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTTPP55157 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTTPP55157 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms