Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PLTPP55058 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLTPP55058 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLTPP55058 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLTPP55058 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLTPP55058 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLTPP55058 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PLTPP55058 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PLTPP55058 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PLTPP55058 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PLTPP55058 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PLTPP55058 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PLTPP55058 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PLTPP55058 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLTPP55058 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLTPP55058 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLTPP55058 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PLTPP55058 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLTPP55058 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLTPP55058 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PLTPP55058 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PLTPP55058 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLTPP55058 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLTPP55058 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLTPP55058 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLTPP55058 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLTPP55058 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLTPP55058 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PLTPP55058 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PLTPP55058 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PLTPP55058 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PLTPP55058 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PLTPP55058 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PLTPP55058 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PLTPP55058 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PLTPP55058 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PLTPP55058 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PLTPP55058 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PLTPP55058 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PLTPP55058 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PLTPP55058 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PLTPP55058 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PLTPP55058 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PLTPP55058 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PLTPP55058 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PLTPP55058 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PLTPP55058 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PLTPP55058 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PLTPP55058 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PLTPP55058 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PLTPP55058 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PLTPP55058 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PLTPP55058 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PLTPP55058 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PLTPP55058 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PLTPP55058 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PLTPP55058 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PLTPP55058 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PLTPP55058 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PLTPP55058 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PLTPP55058 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PLTPP55058 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PLTPP55058 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PLTPP55058 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PLTPP55058 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PLTPP55058 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PLTPP55058 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLTPP55058 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLTPP55058 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLTPP55058 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLTPP55058 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLTPP55058 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLTPP55058 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PLTPP55058 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PLTPP55058 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PLTPP55058 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PLTPP55058 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PLTPP55058 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PLTPP55058 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PLTPP55058 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLTPP55058 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLTPP55058 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLTPP55058 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLTPP55058 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLTPP55058 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLTPP55058 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLTPP55058 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLTPP55058 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLTPP55058 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLTPP55058 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PLTPP55058 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PLTPP55058 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PLTPP55058 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLTPP55058 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLTPP55058 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLTPP55058 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLTPP55058 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLTPP55058 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLTPP55058 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PLTPP55058 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms