Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NRLP54845 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NRLP54845 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NRLP54845 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NRLP54845 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NRLP54845 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NRLP54845 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NRLP54845 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NRLP54845 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NRLP54845 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NRLP54845 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NRLP54845 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NRLP54845 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NRLP54845 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NRLP54845 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NRLP54845 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NRLP54845 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NRLP54845 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NRLP54845 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NRLP54845 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NRLP54845 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NRLP54845 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NRLP54845 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NRLP54845 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NRLP54845 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NRLP54845 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NRLP54845 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
NRLP54845 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NRLP54845 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NRLP54845 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NRLP54845 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NRLP54845 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NRLP54845 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NRLP54845 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.51■■■□□ 2
NRLP54845 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NRLP54845 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NRLP54845 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NRLP54845 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NRLP54845 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NRLP54845 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NRLP54845 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NRLP54845 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NRLP54845 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NRLP54845 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NRLP54845 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NRLP54845 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NRLP54845 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NRLP54845 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NRLP54845 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NRLP54845 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NRLP54845 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NRLP54845 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NRLP54845 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NRLP54845 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NRLP54845 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NRLP54845 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NRLP54845 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NRLP54845 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NRLP54845 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NRLP54845 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NRLP54845 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NRLP54845 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NRLP54845 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NRLP54845 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NRLP54845 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NRLP54845 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NRLP54845 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NRLP54845 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NRLP54845 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NRLP54845 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NRLP54845 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NRLP54845 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NRLP54845 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NRLP54845 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NRLP54845 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NRLP54845 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NRLP54845 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NRLP54845 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NRLP54845 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NRLP54845 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NRLP54845 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NRLP54845 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NRLP54845 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NRLP54845 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NRLP54845 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NRLP54845 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NRLP54845 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NRLP54845 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NRLP54845 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NRLP54845 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NRLP54845 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NRLP54845 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NRLP54845 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NRLP54845 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NRLP54845 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NRLP54845 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NRLP54845 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NRLP54845 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NRLP54845 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NRLP54845 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms