Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LIMK2P53671 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LIMK2P53671 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LIMK2P53671 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LIMK2P53671 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LIMK2P53671 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LIMK2P53671 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LIMK2P53671 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LIMK2P53671 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LIMK2P53671 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LIMK2P53671 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LIMK2P53671 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LIMK2P53671 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LIMK2P53671 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LIMK2P53671 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LIMK2P53671 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LIMK2P53671 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LIMK2P53671 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LIMK2P53671 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LIMK2P53671 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LIMK2P53671 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LIMK2P53671 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LIMK2P53671 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LIMK2P53671 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LIMK2P53671 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LIMK2P53671 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LIMK2P53671 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LIMK2P53671 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LIMK2P53671 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LIMK2P53671 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LIMK2P53671 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LIMK2P53671 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LIMK2P53671 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LIMK2P53671 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LIMK2P53671 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LIMK2P53671 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LIMK2P53671 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LIMK2P53671 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LIMK2P53671 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LIMK2P53671 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LIMK2P53671 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LIMK2P53671 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LIMK2P53671 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LIMK2P53671 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LIMK2P53671 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LIMK2P53671 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LIMK2P53671 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LIMK2P53671 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LIMK2P53671 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LIMK2P53671 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LIMK2P53671 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LIMK2P53671 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LIMK2P53671 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LIMK2P53671 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LIMK2P53671 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LIMK2P53671 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LIMK2P53671 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LIMK2P53671 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LIMK2P53671 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LIMK2P53671 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LIMK2P53671 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LIMK2P53671 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LIMK2P53671 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LIMK2P53671 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LIMK2P53671 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LIMK2P53671 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LIMK2P53671 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LIMK2P53671 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LIMK2P53671 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LIMK2P53671 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LIMK2P53671 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LIMK2P53671 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LIMK2P53671 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LIMK2P53671 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LIMK2P53671 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LIMK2P53671 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LIMK2P53671 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LIMK2P53671 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LIMK2P53671 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LIMK2P53671 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LIMK2P53671 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LIMK2P53671 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LIMK2P53671 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
LIMK2P53671 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LIMK2P53671 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LIMK2P53671 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LIMK2P53671 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LIMK2P53671 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LIMK2P53671 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LIMK2P53671 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LIMK2P53671 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LIMK2P53671 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LIMK2P53671 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LIMK2P53671 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LIMK2P53671 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LIMK2P53671 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LIMK2P53671 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LIMK2P53671 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LIMK2P53671 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LIMK2P53671 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms