Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARFIP2P53365 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARFIP2P53365 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARFIP2P53365 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARFIP2P53365 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARFIP2P53365 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARFIP2P53365 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARFIP2P53365 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARFIP2P53365 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARFIP2P53365 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARFIP2P53365 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARFIP2P53365 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARFIP2P53365 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARFIP2P53365 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARFIP2P53365 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARFIP2P53365 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARFIP2P53365 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARFIP2P53365 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARFIP2P53365 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARFIP2P53365 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARFIP2P53365 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARFIP2P53365 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
ARFIP2P53365 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARFIP2P53365 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARFIP2P53365 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARFIP2P53365 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARFIP2P53365 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARFIP2P53365 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ARFIP2P53365 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARFIP2P53365 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARFIP2P53365 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARFIP2P53365 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARFIP2P53365 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARFIP2P53365 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARFIP2P53365 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARFIP2P53365 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARFIP2P53365 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARFIP2P53365 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARFIP2P53365 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARFIP2P53365 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARFIP2P53365 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARFIP2P53365 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARFIP2P53365 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARFIP2P53365 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARFIP2P53365 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARFIP2P53365 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARFIP2P53365 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARFIP2P53365 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARFIP2P53365 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARFIP2P53365 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARFIP2P53365 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARFIP2P53365 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARFIP2P53365 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARFIP2P53365 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARFIP2P53365 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARFIP2P53365 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARFIP2P53365 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARFIP2P53365 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARFIP2P53365 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARFIP2P53365 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARFIP2P53365 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARFIP2P53365 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARFIP2P53365 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARFIP2P53365 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARFIP2P53365 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ARFIP2P53365 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARFIP2P53365 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARFIP2P53365 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARFIP2P53365 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARFIP2P53365 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARFIP2P53365 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARFIP2P53365 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARFIP2P53365 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARFIP2P53365 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARFIP2P53365 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARFIP2P53365 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARFIP2P53365 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARFIP2P53365 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARFIP2P53365 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARFIP2P53365 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ARFIP2P53365 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARFIP2P53365 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARFIP2P53365 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARFIP2P53365 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARFIP2P53365 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARFIP2P53365 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARFIP2P53365 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARFIP2P53365 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARFIP2P53365 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARFIP2P53365 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARFIP2P53365 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARFIP2P53365 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARFIP2P53365 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARFIP2P53365 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARFIP2P53365 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARFIP2P53365 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARFIP2P53365 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARFIP2P53365 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARFIP2P53365 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARFIP2P53365 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms