Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CASP5P51878 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CASP5P51878 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CASP5P51878 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CASP5P51878 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CASP5P51878 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CASP5P51878 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CASP5P51878 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CASP5P51878 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CASP5P51878 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CASP5P51878 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CASP5P51878 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CASP5P51878 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CASP5P51878 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CASP5P51878 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASP5P51878 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASP5P51878 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASP5P51878 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASP5P51878 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CASP5P51878 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CASP5P51878 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CASP5P51878 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CASP5P51878 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CASP5P51878 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CASP5P51878 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CASP5P51878 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CASP5P51878 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CASP5P51878 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CASP5P51878 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CASP5P51878 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CASP5P51878 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CASP5P51878 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CASP5P51878 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CASP5P51878 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CASP5P51878 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CASP5P51878 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CASP5P51878 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CASP5P51878 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CASP5P51878 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CASP5P51878 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CASP5P51878 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CASP5P51878 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CASP5P51878 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CASP5P51878 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CASP5P51878 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CASP5P51878 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CASP5P51878 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CASP5P51878 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CASP5P51878 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASP5P51878 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASP5P51878 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASP5P51878 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASP5P51878 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASP5P51878 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CASP5P51878 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CASP5P51878 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASP5P51878 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASP5P51878 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASP5P51878 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CASP5P51878 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CASP5P51878 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CASP5P51878 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CASP5P51878 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
CASP5P51878 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CASP5P51878 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASP5P51878 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASP5P51878 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASP5P51878 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASP5P51878 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CASP5P51878 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CASP5P51878 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASP5P51878 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASP5P51878 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASP5P51878 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASP5P51878 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASP5P51878 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASP5P51878 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASP5P51878 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASP5P51878 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASP5P51878 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASP5P51878 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CASP5P51878 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CASP5P51878 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CASP5P51878 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CASP5P51878 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CASP5P51878 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CASP5P51878 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CASP5P51878 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CASP5P51878 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CASP5P51878 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CASP5P51878 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CASP5P51878 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CASP5P51878 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CASP5P51878 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CASP5P51878 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CASP5P51878 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CASP5P51878 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CASP5P51878 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CASP5P51878 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CASP5P51878 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms